RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 CDC27P30260 824 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 DEKP35659 375 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 GSTO1P78417 241 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 GUCY1B3Q02153 619 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 AOC3Q16853 763 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 FBXL16Q8N461 479 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 CNKSR1Q969H4 720 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 KRT23Q9C075 422 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 MCM9Q9NXL9 1143 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 ANAPC4Q9UJX5 808 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 CNPY2Q9Y2B0 182 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 WDR19Q8NEZ3 1342 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 SNED1Q8TER0 1413 aa7.17□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 COL4A5P29400 1685 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 UBE2Q2LH0YL09 131 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 ECE2O60344 883 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 LDHCP07864 332 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 SMPD1P17405 629 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 USP5P45974 858 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 RHBDL3P58872 404 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 PKDCCQ504Y2 493 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 FAM47AQ5JRC9 791 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 APOA5Q6Q788 366 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 MICU3Q86XE3 530 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 TEX11Q8IYF3 940 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 SLC44A5Q8NCS7 719 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM87BQ96K49 555 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 AIFM3Q96NN9 605 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 MYH6P13533 1939 aa7.16□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 YDJCA8MPS7 323 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 BAG3O95817 575 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 PLCD1P51178 756 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 RESTQ13127 1097 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 WTAPQ15007 396 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 SEC23AQ15436 765 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 SBK1Q52WX2 424 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 C12orf60Q5U649 245 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 USP48Q86UV5 1035 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 FAM184AQ8NB25 1140 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 GPT2Q8TD30 523 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 PHKBQ93100 1093 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 CHMP4CQ96CF2 233 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 EYA3Q99504 573 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 GAKO14976 1311 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 TNKSO95271 1327 aa7.15□□□□□ -1.26
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC69A6NI79 296 aa7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 H3BQV1 296 aa7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 CPLX1O14810 134 aa7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 ST8SIA5O15466 376 aa7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 ZBTB43O43298 467 aa7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 PPIP5K2O43314 1243 aa7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 FIBPO43427 364 aa7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 ORC4O43929 436 aa7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 ALDH1A1P00352 501 aa7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 FGRP09769 529 aa7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 SLURP2P0DP57 97 aa7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 MYH8P13535 1937 aa7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 FLT1P17948 1338 aa7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 PDCP20941 246 aa7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SKAP2-204ENST00000481204 LIFRP42702 1097 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms