RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 TMX2Q9Y320 296 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 ALPK3Q96L96 1907 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 A0A0C4DFX4 3053 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 GNAT2P19087 354 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 ADORA2AP29274 412 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 DSG3P32926 999 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 CPXCR1Q8N123 301 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 FLRT1Q9NZU1 646 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 PARP14Q460N5 1801 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 FRMPD3Q5JV73 1810 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 TSPY3P0CV98 308 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 TSPY8P0CW00 308 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 RASA1P20936 1047 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 PDE4BQ07343 736 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 LBX2Q6XYB7 198 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 MB21D1Q8N884 522 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 RILPL2Q969X0 211 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 MMP19Q99542 508 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 LNPKQ9C0E8 428 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 STAP2Q9UGK3 403 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 RLFQ13129 1914 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 STRNO43815 780 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 PGK2P07205 417 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 FCER1AP12319 257 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 STAT3P40763 770 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 GRB14Q14449 540 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 KCTD2Q14681 263 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM132BQ14DG7 1078 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 SBK1Q52WX2 424 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 PI4K2BQ8TCG2 481 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 USP6NLQ92738 828 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 KIFC2Q96AC6 838 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 MROH8Q9H579 483 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 TSPY2A6NKD2 308 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 F5H6K3 240 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 COBLO75128 1261 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 ZBED4O75132 1171 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 TFAP4Q01664 338 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 KLRC3Q07444 240 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 PPARAQ07869 468 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 GIMAP6Q6P9H5 292 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 DDX11Q96FC9 970 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 CEP95Q96GE4 821 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 PRO3102Q9H379 93 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 INCENPQ9NQS7 918 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 VWA5AO00534 786 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A27O95847 323 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFB10O96000 172 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 PDE1AP54750 535 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 SLFN13Q68D06 897 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 SHCBP1Q8NEM2 672 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 FERMT2Q96AC1 680 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 EVI5LQ96CN4 794 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 NYAP2Q9P242 653 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 STX8Q9UNK0 236 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-209ENST00000480420 A0A0G2JMZ2 1700 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms