RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CEP95Q96GE4 821 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GDPD2Q9HCC8 539 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM198AQ9UFP1 575 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SIPA1L1O43166 1804 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PPFIA3O75145 1194 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BMP15O95972 392 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SCG2P13521 617 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRT2P35908 639 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SAPCD2Q86UD0 394 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NOSTRINQ8IVI9 506 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BICD2Q8TD16 824 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GPT2Q8TD30 523 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HOOK2Q96ED9 719 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CSRNP1Q96S65 589 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WNT10BO00744 389 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AOC2O75106 756 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SHMT1P34896 483 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF445P59923 1031 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EVX2Q03828 476 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TATDN1Q6P1N9 297 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KLRF2D3W0D1 207 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DTNBO60941 627 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PLEKHA8P1O95397 391 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AKR1B1P15121 316 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DEKP35659 375 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ME1P48163 572 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MRE11P49959 708 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NLRP5P59047 1200 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FUT2Q10981 343 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ABCB5Q2M3G0 1257 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANO1Q5XXA6 986 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DLK2Q6UY11 383 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 VEZTQ9HBM0 779 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NYAP2Q9P242 653 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPTLC2O15270 562 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TBC1D12O60347 775 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAP2K2P36507 400 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NASPP49321 788 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM173BQ6P4H8 233 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SH2D4AQ9H788 454 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GINM1Q9NU53 330 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MYH8P13535 1937 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A1W2PQ27 194 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A1W2PQ64 194 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A1W2PQD8 194 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CTAGE5O15320 804 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PPP6R2O75170 966 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GNA11P29992 359 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRAPPC10P48553 1259 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CACNB3P54284 484 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ATP2B2Q01814 1243 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRAF1Q13077 416 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DCAF4Q8WV16 495 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MKL1Q969V6 931 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HHIPL1Q96JK4 782 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AIFM3Q96NN9 605 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 USP28Q96RU2 1077 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms