RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 DPP9Q86TI2 863 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 ABRAQ8N0Z2 381 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 NEDD1Q8NHV4 660 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 MKL1Q969V6 931 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 SLC5A4Q9NY91 659 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 MTMR4Q9NYA4 1195 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 CLIP2Q9UDT6 1046 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 RLFQ13129 1914 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 TTLL1O95922 423 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 IGHDP01880 384 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 TSPY3P0CV98 308 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 TSPY8P0CW00 308 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 NUCB1Q02818 461 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 FAM83BQ5T0W9 1011 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 NCAPG2Q86XI2 1143 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 OGDHLQ9ULD0 1010 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 NR2E3Q9Y5X4 410 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 VWA5AO00534 786 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 NDUFB10O96000 172 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 ADORA2AP29274 412 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 COPB2P35606 906 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 TFAP4Q01664 338 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 TMEM132BQ14DG7 1078 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 ALX1Q15699 326 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 CEP95Q96GE4 821 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 ZNF236Q9UL36 1845 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 H0YGN5 161 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 FOXP2O15409 715 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 SLC34A2O95436 690 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 FCER1AP12319 257 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 OLFML2BQ68BL8 750 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 RIOX2Q8IUF8 465 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 NPLOC4Q8TAT6 608 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 RILPL2Q969X0 211 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 SLF1Q9BQI6 1058 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 NBPF3Q9H094 633 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 ANAPC4Q9UJX5 808 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 MSCO60682 206 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 STAT3P40763 770 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 FAM227BQ96M60 508 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 FLRT1Q9NZU1 646 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 PARP14Q460N5 1801 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-205ENST00000467594 TSPY2A6NKD2 308 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 EVI5O60447 810 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 FAM47AQ5JRC9 791 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 VPS53Q5VIR6 699 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 FEM1BQ9UK73 627 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 A0A0D9SFI3 127 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 IGHA2P01877 340 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 CTDSPL2Q05D32 466 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 KCTD2Q14681 263 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 LHX8Q68G74 356 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 REPS2Q8NFH8 660 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 MMP19Q99542 508 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 ZMYM6O95789 1325 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 ATP2A1O14983 1001 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 ORC4O43929 436 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 COBLO75128 1261 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 ZBED4O75132 1171 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 FGAP02671 866 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 SDSP20132 328 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 CNGA1P29973 690 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 CYP2C19P33261 490 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 SLFN13Q68D06 897 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 TEX13BQ9BXU2 312 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 C11orf49Q9H6J7 331 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 CCDC171Q6TFL3 1326 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 MYH4Q9Y623 1939 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 HIP1O00291 1037 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 FGRP09769 529 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 FDX1P10109 184 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 BMP3P12645 472 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms