RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 KCNB2Q92953 911 aa12.96□□□□□ -0.33
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RPRD1B-202ENST00000449186 CPVLQ9H3G5 476 aa12.96□□□□□ -0.33
RPRD1B-202ENST00000449186 SH2D4AQ9H788 454 aa12.96□□□□□ -0.33
RPRD1B-202ENST00000449186 CNNM2Q9H8M5 875 aa12.96□□□□□ -0.33
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RPRD1B-202ENST00000449186 DOCK3Q8IZD9 2030 aa12.94□□□□□ -0.34
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A0G2JMZ2 1700 aa12.93□□□□□ -0.34
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RPRD1B-202ENST00000449186 MORF4L1Q9UBU8 362 aa12.92□□□□□ -0.34
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RPRD1B-202ENST00000449186 SLC4A3P48751 1232 aa12.91□□□□□ -0.34
RPRD1B-202ENST00000449186 ERVK-9P63128 1117 aa12.91□□□□□ -0.34
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RPRD1B-202ENST00000449186 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
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RPRD1B-202ENST00000449186 RIPK3Q9Y572 518 aa12.91□□□□□ -0.34
RPRD1B-202ENST00000449186 TRIM17Q9Y577 477 aa12.91□□□□□ -0.34
RPRD1B-202ENST00000449186 PLXNB2O15031 1838 aa12.9□□□□□ -0.34
RPRD1B-202ENST00000449186 CASTP20810 708 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RPRD1B-202ENST00000449186 IKQ13123 557 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
RPRD1B-202ENST00000449186 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RPRD1B-202ENST00000449186 NBPF11Q86T75 865 aa12.9□□□□□ -0.34
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa12.9□□□□□ -0.34
RPRD1B-202ENST00000449186 CPXCR1Q8N123 301 aa12.9□□□□□ -0.34
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