RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.33■■□□□ 1.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTMR7Q9Y216 660 aa21.33■■□□□ 1.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FANCLQ9NW38 375 aa21.33■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.32■■□□□ 1
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAGE5Q96GU1 130 aa21.31■■□□□ 1
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.3■■□□□ 1
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.3■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.3■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPF2Q92785 391 aa21.3■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEP95Q96GE4 821 aa21.3■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.3■■□□□ 1
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 STXBP3O00186 592 aa21.3■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AFMP43652 599 aa21.3■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL17AQ16552 155 aa21.3■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALNT17Q6IS24 598 aa21.3■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.3■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CERS5Q8N5B7 392 aa21.3■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 F8W031 263 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALDH1B1P30837 517 aa21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOVP48745 357 aa21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFAP100Q494V2 611 aa21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPYDQ12882 1025 aa21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PICALMQ13492 652 aa21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 E2F4Q16254 413 aa21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.28■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYH8P13535 1937 aa21.27■■□□□ 1
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDE6BP35913 854 aa21.27■■□□□ 1
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF18P17022 549 aa21.27■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CASP1P29466 404 aa21.27■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GABPAQ06546 454 aa21.27■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.27■□□□□ 0.99
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED15Q96RN5 788 aa21.27■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.27■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.27■□□□□ 0.99
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 APBA3O96018 575 aa21.26■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSDMAQ96QA5 445 aa21.26■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MXD3Q9BW11 206 aa21.25■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.25■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCND1Q9NSA2 647 aa21.25■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.25■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMARCA1P28370 1054 aa21.25■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDXDC2PQ6P474 469 aa21.25■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VSTM4Q8IW00 320 aa21.25■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.25■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MASTLQ96GX5 879 aa21.25■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INTS13Q9NVM9 706 aa21.25■□□□□ 0.99
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INF2Q27J81 1249 aa21.24■□□□□ 0.99
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