RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.52■■□□□ 1.04
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PTPRN2-204ENST00000404321 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.48■■□□□ 1.03
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PTPRN2-204ENST00000404321 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRN2-204ENST00000404321 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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PTPRN2-204ENST00000404321 SLC1A4P43007 532 aa21.45■■□□□ 1.02
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PTPRN2-204ENST00000404321 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.028e-7■■■■■ 31.2
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PTPRN2-204ENST00000404321 MROH8Q9H579 483 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTPRN2-204ENST00000404321 ESR2Q92731 530 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 GMCL1Q96IK5 515 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 B4E1Z4 1266 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 COBLO75128 1261 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 ZBED4O75132 1171 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 KDM4AO75164 1064 aa21.42■■□□□ 1.02
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