RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 MYO1CO00159 1063 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 BTDP43251 543 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 BIRC2Q13490 618 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 TUBB2AQ13885 445 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 UIMC1Q96RL1 719 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ATP10DQ9P241 1426 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ATP8B1O43520 1251 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 STK24Q9Y6E0 443 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CFBP00751 764 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 APBA3O96018 575 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 TNNC1P63316 161 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 PTGDRQ13258 359 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 PDE6BP35913 854 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 FANCLQ9NW38 375 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 LAMC1P11047 1609 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 PRKAB2O43741 272 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GALNT17Q6IS24 598 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 IFT81Q8WYA0 676 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ERFEQ4G0M1 354 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ZBTB9Q96C00 473 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ATP11AP98196 1134 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 DLGAP5Q15398 846 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CPXCR1Q8N123 301 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 LCORLQ8N3X6 602 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 FAM212AQ96EL1 285 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 IFT74Q96LB3 600 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 XDHP47989 1333 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 MAGEA9P43362 315 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 LIG3P49916 1009 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 PPP6R2O75170 966 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 MAGEA1P43355 309 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 SMTNP53814 917 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 NEK8Q86SG6 692 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 PICK1Q9NRD5 415 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 PPIP5K2O43314 1243 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 OR52Z1P0C646 297 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GJC1P36383 396 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 KCNQ4P56696 695 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 RASGRF1Q13972 1273 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC38Q502W7 563 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 DDX12PQ92771 950 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC169A6NNP5 214 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 TECP42680 631 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 SCNN1DP51172 638 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 IFNAR1P17181 557 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 HLFQ16534 295 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 SUSD4Q5VX71 490 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC51Q96ER9 411 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms