RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 NEBLO76041 1014 aa24.34■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 IFT88Q13099 833 aa24.34■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.34■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 KIAA1328Q86T90 577 aa24.34■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.34■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 CDR1P51861 262 aa24.33■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.493e-6■■■□□ 17.9
OPN3-201ENST00000366554 SNCBQ16143 134 aa24.33■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 CENPHQ9H3R5 247 aa24.33■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.33■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 NLRP14Q86W24 1093 aa24.33■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 FMNL3Q8IVF7 1028 aa24.33■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 IQCKQ8N0W5 287 aa24.33■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 ABTB2Q8N961 1025 aa24.33■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 SPATA4Q8NEY3 305 aa24.33■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 SNX12Q9UMY4 172 aa24.33■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
OPN3-201ENST00000366554 TMEM94Q12767 1356 aa24.33■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 KCNJ18B7U540 433 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 TNFRSF8P28908 595 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 UBXN1Q04323 297 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 KCNJ12Q14500 433 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 PARP9Q8IXQ6 854 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 OSCARQ8IYS5 282 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 EPSTI1Q96J88 318 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 RWDD2AQ9UIY3 292 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 KCNJ14Q9UNX9 436 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 A0A087WZG4 1122 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 FAM107AO95990 144 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 GUCY1A2P33402 732 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 SEC24CP53992 1094 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 SLC7A5Q01650 507 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 TLDC1Q6P9B6 456 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 CYB5D1Q6P9G0 228 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 POLD4Q9HCU8 107 aa24.32■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 MEA1Q16626 185 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 CEP57Q86XR8 500 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 FUKQ8N0W3 1084 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 APPBP2Q92624 585 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 STIM2Q9P246 746 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 DUSP10Q9Y6W6 482 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 PDHBP11177 359 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 PPARAQ07869 468 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 CAPN11Q9UMQ6 739 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 USP54Q70EL1 1684 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 ZNF233A6NK53 670 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 MYL10Q9BUA6 226 aa24.31■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 NR5A1Q13285 461 aa24.3■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 WASF1Q92558 559 aa24.3■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 SGSM3Q96HU1 749 aa24.3■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.3■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 NR1D1P20393 614 aa24.3■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 MDH1P40925 334 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 FOXO4P98177 505 aa24.3■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 APBA1Q02410 837 aa24.3■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.3■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 TMEM87BQ96K49 555 aa24.3■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 GPAA1O43292 621 aa24.29■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 LY9Q9HBG7 655 aa24.29■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 A0A1B0GUA9 196 aa24.29■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 PRLRP16471 622 aa24.29■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 IFNAR1P17181 557 aa24.29■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 CALRP27797 417 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.29■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 MB21D1Q8N884 522 aa24.29■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 CCDC114Q96M63 670 aa24.29■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.29■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.29■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 A0A1W2PQC6 194 aa24.28■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 EZRP15311 586 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 SLC24A3Q9HC58 644 aa24.28■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms