RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287538.9

ZIC3-201, Transcript of Zic family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZIC3, Length 3,469 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3-201ENST00000287538 STK32BQ9NY57 414 aa14.62□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 TRIM75PA6NK02 468 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 KIF5BP33176 963 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 CCDC96Q2M329 555 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 SHC4Q6S5L8 630 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 FBXL16Q8N461 479 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 CERS5Q8N5B7 392 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 WNK3Q9BYP7 1800 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 ADAMTS3O15072 1205 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 CAVIN2O95810 425 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 NFIAQ12857 509 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 LONRF3Q496Y0 759 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 SP8Q8IXZ3 490 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 ANO10Q9NW15 660 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 RAD17O75943 681 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 GPS2Q13227 327 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.61□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 KLRF2D3W0D1 207 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 SLF2Q8IX21 1173 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 CEP95Q96GE4 821 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 MASTLQ96GX5 879 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 EPSTI1Q96J88 318 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 EFCC1Q9HA90 598 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 WNT7AO00755 349 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 SLC16A2P36021 539 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 ZSCAN26Q16670 478 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 FLT1P17948 1338 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 MYO1CO00159 1063 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 MNS1Q8NEH6 495 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.6□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 PPIP5K2O43314 1243 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 CALM1P0DP23 149 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 CALM2P0DP24 149 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 CALM3P0DP25 149 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 SCG2P13521 617 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 PKN1Q16512 942 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 CSRNP2Q9H175 543 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 CLRN2A0PK11 232 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 ZBTB7AO95365 584 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 RASA1P20936 1047 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 NAPAP54920 295 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 ATL3Q6DD88 541 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 C4BP0C0L5 1744 aa14.59□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 CTAGE5O15320 804 aa14.58□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 GYS2P54840 703 aa14.58□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.58□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.58□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 CCDC34Q96HJ3 373 aa14.58□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
ZIC3-201ENST00000287538 CMA1P23946 247 aa14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 GSDMDP57764 484 aa14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 CCDC93Q567U6 631 aa14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 TEKT1Q969V4 418 aa14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 USP17L5A8MUK1 530 aa14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 AKR1B1P15121 316 aa14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 STX17P56962 302 aa14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 PTGDRQ13258 359 aa14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 INF2Q27J81 1249 aa14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 SHISA4Q96DD7 197 aa14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 COA1Q9GZY4 146 aa14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 DNAI1Q9UI46 699 aa14.58□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 ORC4O43929 436 aa14.57□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 PLCG2P16885 1265 aa14.57□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 SNAP25P60880 206 aa14.57□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 RGS22Q8NE09 1264 aa14.57□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 VEZTQ9HBM0 779 aa14.57□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 GDF11O95390 407 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms