RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 COBLO75128 1261 aa25.18■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 APPP05067 770 aa25.18■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 RASA1P20936 1047 aa25.18■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 CYBAP13498 195 aa25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 SYN1P17600 705 aa25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 TDO2P48775 406 aa25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 TRPV1Q8NER1 839 aa25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 NYAP2Q9P242 653 aa25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 VWA5AO00534 786 aa25.16■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 STAT3P40763 770 aa25.16■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.16■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.16■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.16■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
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NEDD8-201ENST00000250495 PARP14Q460N5 1801 aa25.15■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 COPB2P35606 906 aa25.15■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC26Q2I0M4 334 aa25.15■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.15■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.15■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 M0R2C6 588 aa25.14■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 DNM1LO00429 736 aa25.14■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 SEPT4O43236 478 aa25.14■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.14■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 MAML3Q96JK9 1138 aa25.14■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 MMP19Q99542 508 aa25.14■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 FRMPD3Q5JV73 1810 aa25.14■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 F5H6K3 240 aa25.13■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 KLRC3Q07444 240 aa25.13■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 KCTD2Q14681 263 aa25.13■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.13■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.13■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.12■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 FSD1Q9BTV5 496 aa25.12■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa25.11■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 REPS2Q8NFH8 660 aa25.11■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 MKL1Q969V6 931 aa25.11■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 NRBP1Q9UHY1 535 aa25.11■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.1■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 PRDM1O75626 825 aa25.1■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 NDUFB10O96000 172 aa25.1■■□□□ 1.61
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NEDD8-201ENST00000250495 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
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NEDD8-201ENST00000250495 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 KBTBD13C9JR72 458 aa25.09■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.09■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.09■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 NAPBQ9H115 298 aa25.09■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.09■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.09■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 TTLL1O95922 423 aa25.08■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 PGK2P07205 417 aa25.08■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF792Q3KQV3 632 aa25.08■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 ANO1Q5XXA6 986 aa25.08■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 TDHQ8IZJ6 230 aa25.08■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 CEP95Q96GE4 821 aa25.08■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 TINF2Q9BSI4 451 aa25.08■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
NEDD8-201ENST00000250495 SZT2Q5T011 3432 aa25.08■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 ZBED4O75132 1171 aa25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 TSPY3P0CV98 308 aa25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 TSPY8P0CW00 308 aa25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 LRIT3Q3SXY7 679 aa25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 LRCH3Q96II8 777 aa25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa25.06■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 FEM1BQ9UK73 627 aa25.06■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 MYH4Q9Y623 1939 aa25.06■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.05■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 ATP2A1O14983 1001 aa25.05■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 PPARAQ07869 468 aa25.05■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 GPR153Q6NV75 609 aa25.05■■□□□ 1.6
NEDD8-201ENST00000250495 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa25.05■■□□□ 1.6
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