RNA–Protein interactions for RNA: YPL157W

TGS1, Transcript of Trimethyl guanosine synthase, conserved nucleolar methyl transferase, yeast

Gene TGS1, Length 948 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TGS1	YPL157W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TGS1	YPL157W	IPI3	P53877	555 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TGS1	YPL157W	FDC1	Q03034	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TGS1	YPL157W	DML1	Q03652	475 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TGS1	YPL157W	RBA50	Q04418	439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TGS1	YPL157W	ENT2	Q05785	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TGS1	YPL157W	ARV1	Q06541	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TGS1	YPL157W	MCP2	Q06567	569 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TGS1	YPL157W	HOS1	Q12214	470 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TGS1	YPL157W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TGS1	YPL157W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TGS1	YPL157W	CDC25	P04821	1589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	CYB2	P00175	591 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	BIK1	P11709	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MRPL25	P23369	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	PRP28	P23394	588 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	VPH2	P32341	215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	NFU1	P32860	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	UIP5	P36137	443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	FZO1	P38297	855 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SFB3	P38810	929 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	PIG2	P40187	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	NPA3	P47122	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MPS2	P53159	387 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ESBP6	P53918	673 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	YML131W	Q03102	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ARO10	Q06408	635 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SDH5	Q08230	162 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	AIM41	Q12032	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	CAT8	P39113	1433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	JIP3	O13555	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SIR3	P06701	978 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MGM1	P32266	881 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MIA40	P36046	403 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SLX1	P38324	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MDV1	P47025	714 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MDR1	P53258	950 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ACS1	Q01574	713 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	CIK1	Q01649	594 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ATG17	Q06410	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	YLH47	Q06493	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SYO1	Q07395	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	TAF3	Q12297	353 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	YPR089W	O13585	888 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	NMT1	P14743	455 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SIR1	P21691	654 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	YKL063C	P35725	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	PHO11	P35842	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	RSM22	P36056	628 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	PHO12	P38693	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	REV7	P38927	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
TGS1	YPL157W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	FMP52	P40008	231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	RTT105	P40063	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	APS3	P47064	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MPS3	P47069	682 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	URB2	P47108	1174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SSN8	P47821	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	FMS1	P50264	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	FHN1	P53279	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	FYV6	P53913	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ADA2	Q02336	434 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	BLS1	Q06071	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	AAD4	Q07747	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MLH3	Q12083	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SCM3	Q12334	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	DNF1	P32660	1571 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	PHO5	P00635	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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