RNA–Protein interactions for RNA: YML039W

YML039W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YML039W, Length 5,268 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML039WYML039W YLL056CQ12177 298 aa2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W SFM1Q12314 213 aa2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W ENO2P00925 437 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W SEC15P22224 910 aa2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W MRX3P38172 270 aa2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W FZO1P38297 855 aa2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W MEF2P39677 819 aa2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W INA22P40576 216 aa2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W EPL1P43572 832 aa2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W STB2P46679 850 aa2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W ADO1P47143 340 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W YGR035CP53222 116 aa2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W ZRG17P53735 605 aa2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W NKP2Q06162 153 aa2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W MED2Q12124 431 aa2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W ATG31Q12421 196 aa2.66□□□□□ -1.98
YML039WYML039W YPT1P01123 206 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W GPA2P10823 449 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W APA1P16550 321 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W COX11P19516 300 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W RPC19P28000 142 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W PSO2P30620 661 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W PDB1P32473 366 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W TCD2P36101 447 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W MEP1P40260 492 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W TOS3P43637 560 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W YGR168CP53293 376 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W TAF11Q04226 346 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W YMR018WQ04364 514 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W PUN1Q06991 263 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W PMA2P19657 947 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W CHS3P29465 1165 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W RAD16P31244 790 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W SLA1P32790 1244 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W SFC1P33303 322 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W RER2P35196 286 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W GMH1P36125 273 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W ARA1P38115 344 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W FUI1P38196 639 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W CCT6P39079 546 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W SWM2P40342 146 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W STP1Q00947 519 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W OSH6Q02201 448 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W SCS7Q03529 384 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W GPI17Q04080 534 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W SEC10Q06245 871 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W YPR172WQ06608 200 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W SPO75Q07798 868 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W WSC3Q12215 556 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W RRI1Q12468 440 aa2.65□□□□□ -1.98
YML039WYML039W GLN4P13188 809 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W AFG1P32317 509 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W SPR1P32603 445 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W YRO2P38079 344 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W CAF120P53836 1060 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W VTC3Q02725 835 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W IRC15Q02733 499 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W YPL067CQ02754 198 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W DDC1Q08949 612 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W AIM41Q12032 185 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W FLO11P08640 1367 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W YPK1P12688 680 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W RCK2P38623 610 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W SKN7P38889 622 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W YHR210CP38893 341 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W DHH1P39517 506 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W SOK1P40317 901 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W AYR1P40471 297 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W YLR030WQ07967 263 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W ULA1Q12059 462 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W YCR075W-AQ3E830 75 aa2.65□□□□□ -1.99
YML039WYML039W RPL22AP05749 121 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W HIS5P07172 385 aa2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W HTS1P07263 546 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W HOP1P20050 605 aa2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W TSR4P25040 408 aa2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W FEN2P25621 512 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data2.64□□□□□ -1.99not detected
YML039WYML039W CCR4P31384 837 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W BLI1P35727 113 aa2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W ADE17P38009 592 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W TRM7P38238 310 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W YHL012WP38709 493 aa2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W DSS1P39112 969 aa2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W YJL206CP39529 758 aa2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
YML039WYML039W TUB4P53378 473 aa2.64□□□□□ -1.99
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