RNA–Protein interactions for RNA: YLR308W

CDA2, Transcript of Chitin deacetylase, yeast

Gene CDA2, Length 939 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CDA2	YLR308W	GSH1	P32477	678 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	PAH1	P32567	862 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	JNM1	P36224	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YBL029W	P38201	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	JHD1	P40034	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	NPA3	P47122	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	FCP1	Q03254	732 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	SNO4	Q04902	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	HSP32	Q08992	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	VCX1	Q99385	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	GAL4	P04386	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	LHS1	P36016	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	AAD10	P47182	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	MSY1	P48527	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	REG1	Q00816	1014 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	HUA2	Q12134	243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	HER1	Q12276	1246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	COX1	P00401	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	CDC16	P09798	840 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	ERG8	P24521	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	PTC6	P25646	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	MRP20	P32387	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	SLZ1	P40167	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	SWA2	Q06677	668 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	CIR2	Q08822	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	MRP7	P12687	371 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	AGP2	P38090	596 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	SRB7	P47822	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	PCD1	Q12524	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	MSS51	P32335	436 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YEL068C	P39977	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	SIP4	P46954	829 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	CRN1	Q06440	651 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	TCO89	Q08921	799 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	MED1	Q12321	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YPR089W	O13585	888 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	INH1	P01097	85 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	PCI8	P40512	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	CFD1	P40558	293 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	STP3	Q05937	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	SPE2	P21182	396 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	ALY1	P36117	915 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	GEX2	P36173	615 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	IME4	P41833	600 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	YPR003C	P53394	754 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	INA17	Q02888	182 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	THI3	Q07471	609 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	PSR1	Q07800	427 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	SAN1	P22470	610 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	ASK1	P35734	292 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	RTS1	P38903	757 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	UIP3	P39547	235 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	SMC3	P47037	1230 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	SPC19	Q03954	165 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDA2	YLR308W	RCN2	Q12044	265 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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