RNA–Protein interactions for RNA: YLL039C

UBI4, Transcript of Ubiquitin, yeast

Gene UBI4, Length 1,146 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBI4	YLL039C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	REV1	P12689	985 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	SFL1	P20134	766 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	MEI4	P29467	408 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	YME2	P32843	850 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	SEC6	P32844	805 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	SGE1	P33335	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	SQT1	P35184	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	SPC42	P36094	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	LAM1	P38851	1228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	YJR079W	P47126	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	ASI1	P54074	624 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	BET4	Q00618	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	INA17	Q02888	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	SPO19	Q03029	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	YHM2	Q04013	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	SEG1	Q04279	960 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	TMN2	Q04562	672 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	ORM2	Q06144	216 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	NSE1	Q07913	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	SPO21	Q12411	609 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
UBI4	YLL039C	IZH4	Q99393	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	RAD10	P06838	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	RPC37	P36121	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	KTR4	P38131	464 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	PCA1	P38360	1216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	MED6	P38782	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	SMF1	P38925	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	END3	P39013	349 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	FLC2	P39719	783 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	HEM14	P40012	539 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	ARG2	P40360	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	GYP8	P43570	497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	BST1	P43571	1029 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	RRT5	P43607	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	TRS85	P46944	698 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	SNG1	P46950	547 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	RFX1	P48743	811 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	SNO2	P53823	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	GRX8	Q05926	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	TPO1	Q07824	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	FLC1	Q08967	793 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	NUR1	Q12066	484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	GPM3	Q12326	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	MPD2	Q99316	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	KIN3	P22209	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	SLY1	P22213	666 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	ADY2	P25613	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	BUD14	P27637	709 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	GPI10	P30777	616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	BIT2	P38346	545 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	ARP1	P38696	384 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	AIM18	P38884	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	STL1	P39932	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	VAC8	P39968	578 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	YEL028W	P39989	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	CHS6	P40955	746 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	CNN1	P43618	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	ALY2	P47029	1046 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	RPC17	P47076	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	YML6	P51998	286 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	DSL1	P53847	754 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	RPN4	Q03465	531 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	ECI1	Q05871	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	NDD1	Q08887	554 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	YDR018C	Q12185	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBI4	YLL039C	WHI5	Q12416	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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