RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	TAF6	P53040	516 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	ATP25	Q03153	612 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	ATG16	Q03818	150 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	YKU80	Q04437	629 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	GTB1	Q04924	702 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	EAF1	Q06337	982 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	CUR1	Q06469	252 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	SUE1	Q06524	206 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	YPT6	Q99260	215 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	FLO11	P08640	1367 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	SWI6	P09959	803 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	PHO8	P11491	566 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	SPS22	P25380	463 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	YUR1	P26725	428 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	YTA12	P40341	825 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	JEM1	P40358	645 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	ASG1	P40467	964 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	YGR111W	P53265	400 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	LSB1	P53281	241 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	ARK1	P53974	638 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	ORC4	P54791	529 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	HFD1	Q04458	532 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	PCL8	Q08966	492 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	SRD1	P09007	221 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	SNA3	P14359	133 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	MRPL25	P23369	157 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	YCL002C	P25565	263 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	ARE1	P25628	610 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	PUP2	P32379	260 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	TOA1	P32773	286 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	MRE11	P32829	692 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	UBS1	P38290	277 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	NDT80	P38830	627 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	TDA11	P38854	504 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	SPC97	P38863	823 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	YMR134W	P40207	237 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	LTP1	P40347	161 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	MRK1	P50873	501 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	DIP5	P53388	608 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	TIM8	P57744	87 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	ERO1	Q03103	563 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	FMN1	Q03778	218 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	INP2	Q03824	705 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	PPM1	Q04081	328 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	UFO1	Q04511	668 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
TVP38	YKR088C	THI21	Q08975	551 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	GPR1	Q12361	961 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	NKP1	Q12493	238 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	GSC2	P40989	1895 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP38	YKR088C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	COY1	P34237	679 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	CCL1	P37366	393 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PFF1	P38244	976 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	POP4	P38336	279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SFB3	P38810	929 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	GSM1	P42950	618 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	NET1	P47035	1189 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	FMS1	P50264	508 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	COS6	P53344	381 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	ATG4	P53867	494 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	OSH6	Q02201	448 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	ERV41	Q04651	352 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	DON1	Q05610	365 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RGT2	Q12300	763 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	ARP6	Q12509	438 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RAD10	P06838	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PMS1	P14242	873 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	TYR1	P20049	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	AEP2	P22136	580 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	YSC83	P32792	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	AST1	P35183	429 aa		4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.2 ms