RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 USP14P54578 494 aa26.61■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 USP17L24Q0WX57 530 aa26.61■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 GUCY1A2P33402 732 aa26.6■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 EVX2Q03828 476 aa26.6■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 SLC15A5A6NIM6 579 aa26.59■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 CNMDO75829 334 aa26.59■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.59■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 UBE3CQ15386 1083 aa26.59■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 LPAR1Q92633 364 aa26.59■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 ARMT1Q9H993 441 aa26.59■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 CABP5Q9NP86 173 aa26.59■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa26.59■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 A0A0G2JMZ2 1700 aa26.59■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 POTEB2H3BUK9 544 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 DNM1LO00429 736 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 MBD4O95243 580 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 HOXC6P09630 235 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 VCAM1P19320 739 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
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SRRT-218ENST00000620394 LBX2Q6XYB7 198 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 ACER1Q8TDN7 264 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 GUCD1Q96NT3 240 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 BCL11AQ9H165 835 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 FLRT1Q9NZU1 646 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 RLFQ13129 1914 aa26.58■■□□□ 1.85
SRRT-218ENST00000620394 PTPREP23469 700 aa26.57■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 GRB14Q14449 540 aa26.57■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 SLFNL1Q499Z3 407 aa26.57■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 DCTPP1Q9H773 170 aa26.57■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 UNC80Q8N2C7 3258 aa26.57■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.56■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 SWAP70Q9UH65 585 aa26.56■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 PRKAB2O43741 272 aa26.55■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 CYP2D6P10635 497 aa26.55■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 ATP2B2Q01814 1243 aa26.55■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 SEPT2Q15019 361 aa26.55■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 ZNF697Q5TEC3 545 aa26.55■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 ECHDC1Q9NTX5 307 aa26.55■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 PARP14Q460N5 1801 aa26.55■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 CHGBP05060 677 aa26.54■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 CNGA1P29973 690 aa26.54■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.54■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.53■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.53■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 CYBAP13498 195 aa26.52■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 RTP1P59025 263 aa26.52■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 BTBD7Q9P203 1132 aa26.52■■□□□ 1.84
SRRT-218ENST00000620394 A0A1W2PRG0 241 aa26.51■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 CYP2C19P33261 490 aa26.51■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 C12orf60Q5U649 245 aa26.51■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 NPLOC4Q8TAT6 608 aa26.51■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.51■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 FAM161BQ96MY7 647 aa26.51■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 IGHA2P01877 340 aa26.49■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 OLFML2BQ68BL8 750 aa26.49■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.49■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.49■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 ARRDC4Q8NCT1 418 aa26.49■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 TRPV1Q8NER1 839 aa26.49■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 GPATCH3Q96I76 525 aa26.49■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 KBTBD13C9JR72 458 aa26.48■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.48■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 CCDC17Q96LX7 622 aa26.48■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa26.48■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.47■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 USP17L12C9JPN9 530 aa26.47■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 USP17L21D6R901 530 aa26.47■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 SMIM22K7EJ46 135 aa26.47■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 AKR1B1P15121 316 aa26.47■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 DPP9Q86TI2 863 aa26.47■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.47■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.47■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 DNAH12Q6ZR08 3092 aa26.46■■□□□ 1.83
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SRRT-218ENST00000620394 ADORA2AP29274 412 aa26.46■■□□□ 1.83
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SRRT-218ENST00000620394 ICA1Q05084 483 aa26.46■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 SNX17Q15036 470 aa26.46■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.46■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.46■■□□□ 1.83
SRRT-218ENST00000620394 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.45■■□□□ 1.82
SRRT-218ENST00000620394 CTR9Q6PD62 1173 aa26.45■■□□□ 1.82
SRRT-218ENST00000620394 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.45■■□□□ 1.82
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