RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619348.4

CYFIP1-211, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CYFIP1, Length 3,471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-211ENST00000619348 GBP6Q6ZN66 633 aa14.87□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 SH2D3CQ8N5H7 860 aa14.87□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 MAP3K14Q99558 947 aa14.87□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.87□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 TUBBP07437 444 aa14.87□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.87□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 DEXIO95424 95 aa14.87□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 ZNF18P17022 549 aa14.87□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 GUCY2CP25092 1073 aa14.87□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 FOXO4P98177 505 aa14.87□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 SPAG1Q07617 926 aa14.87□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 PTGDRQ13258 359 aa14.87□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 RASGRP2Q7LDG7 609 aa14.87□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 TTC26A0AVF1 554 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 PDE6AP16499 860 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 PHKA1P46020 1223 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 KRT83P78385 493 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 SCLT1Q96NL6 688 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 UTYO14607 1347 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 MCAMP43121 646 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 TUBB4BP68371 445 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 TUBB2AQ13885 445 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 COG1Q8WTW3 980 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 KRT2P35908 639 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 UBA7P41226 1012 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 USP14P54578 494 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 MCTP2Q6DN12 878 aa14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 B4DLN1 442 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 TBX22Q9Y458 520 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 PEAK1Q9H792 1746 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 ESYT3A0FGR9 886 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 CUL4BQ13620 913 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 CFAP58Q5T655 872 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 EXOC5O00471 708 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 OPA1O60313 960 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 PHKG2P15735 406 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 ITGA6P23229 1130 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 TTC38Q5R3I4 469 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 FANCBQ8NB91 859 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 STRN4Q9NRL3 753 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 EHD2Q9NZN4 543 aa14.85□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 IRAK1P51617 712 aa14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 MED15Q96RN5 788 aa14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 LY9Q9HBG7 655 aa14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 RAB21Q9UL25 225 aa14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 BUB1O43683 1085 aa14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 TACC1O75410 805 aa14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 FAM212AQ96EL1 285 aa14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 KRT23Q9C075 422 aa14.84□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 MYBL2P10244 700 aa14.83□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.83□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 C8orf74Q6P047 294 aa14.83□□□□□ -0.03
CYFIP1-211ENST00000619348 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122 ms