RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	TNFRSF10C	O14798	259 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	ESR1	P03372	595 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	ACR	P10323	421 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	IKZF1	Q13422	519 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	GAB4	Q2WGN9	574 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	UBE2F	Q969M7	185 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	GINM1	Q9NU53	330 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
COX11-208	ENST00000576084	RAG1	P15918	1043 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	GJA8	P48165	433 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	ZP2	Q05996	745 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	TMEM192	Q8IY95	271 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	SLC9A7	Q96T83	725 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	ASPN	Q9BXN1	380 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	PPT2	Q9UMR5	302 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	SHISA3	A0PJX4	238 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	PAPLN	O95428	1278 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	GBP1	P32455	592 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	SOX9	P48436	509 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	TNNI2	P48788	182 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	MLEC	Q14165	292 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	CCNF	P41002	786 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	5.75	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	FZD5	Q13467	585 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	GPRASP2	Q96D09	838 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	IMPDH2	P12268	514 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	SLC6A18	Q96N87	628 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	TM9SF2	Q99805	663 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	HDAC8	Q9BY41	377 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
COX11-208	ENST00000576084	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084		C9IYK1	514 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	SHOX	O15266	292 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	CLEC3A	O75596	197 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	TCF3	P15923	654 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	GIPR	P48546	466 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	RNF4	P78317	190 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	CREG2	Q8IUH2	290 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	SHD	Q96IW2	340 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	SPATA32	Q96LK8	384 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	SP110	Q9HB58	689 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	RNF114	Q9Y508	228 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	GUCY2C	P25092	1073 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	TEK	Q02763	1124 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COX11-208	ENST00000576084	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5

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