RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 NPHP1O15259 732 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 FZD6O60353 706 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 ICMTO60725 284 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 KIF4AO95239 1232 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 GHRHP01286 108 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 GYS1P13807 737 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 ELNP15502 786 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 RAC1P63000 192 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 DDR1Q08345 913 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 HYAL2Q12891 473 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 GPR162Q16538 588 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 RUNDC1Q96C34 613 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 SYT17Q9BSW7 474 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 USP16Q9Y5T5 823 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 LRRC37AA6NMS7 1700 aa5.57□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 RPS6KA4O75676 772 aa5.57□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 CHRNA5P30532 468 aa5.57□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 ATP11AP98196 1134 aa5.57□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 XKR5Q6UX68 686 aa5.57□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.57□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 GLYCTKQ8IVS8 523 aa5.57□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 GJD3Q8N144 294 aa5.57□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 RBSNQ9H1K0 784 aa5.57□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 A0A0G2JLW4 131 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 GPTP24298 496 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 USP5P45974 858 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 PROSER3Q2NL68 480 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 C8orf34Q49A92 452 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 TBC1D9BQ66K14 1250 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 SLC51AQ86UW1 340 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 SNX29Q8TEQ0 813 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 NACC1Q96RE7 527 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 CHRDQ9H2X0 955 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 CNTN3Q9P232 1028 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 KANSL3Q9P2N6 904 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 TRIM33Q9UPN9 1127 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 ABCC12Q96J65 1359 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 PSME4Q14997 1843 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 STARD3NLO95772 234 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 YY1P25490 414 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 EHHADHQ08426 723 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 LMOD3Q0VAK6 560 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 AAMPQ13685 434 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 NFIXQ14938 502 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 GRIK4Q16099 956 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 ECM1Q16610 540 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 C1orf127Q8N9H9 656 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 TTC16Q8NEE8 873 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 FLAD1Q8NFF5 587 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 SPACA7Q96KW9 195 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 TNFRSF21O75509 655 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 DPEP1P16444 411 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 CES1P23141 567 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGAP4P98171 946 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 HLFQ16534 295 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 NCAPG2Q86XI2 1143 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 RASSF4Q9H2L5 321 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 NARFQ9UHQ1 456 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 WDR90Q96KV7 1748 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 UTRNP46939 3433 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 PHACTR2O75167 634 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 CAMTA2O94983 1202 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 SERPINB2P05120 415 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 ACPPP15309 386 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 SELPP16109 830 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 EIF5P55010 431 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 MBTPS1Q14703 1052 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 SHISA2Q6UWI4 295 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 KIF6Q6ZMV9 814 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 CEP120Q8N960 986 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 CNBD1Q8NA66 436 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 PBX4Q9BYU1 374 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 SALL4Q9UJQ4 1053 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms