RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 CCNA1P78396 465 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 LPAR1Q92633 364 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 VCPKMTQ9H867 229 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 CNMDO75829 334 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 IGHDP01880 384 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 GJB1P08034 283 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 CYP2B6P20813 491 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 WDR78Q5VTH9 848 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 NAPBQ9H115 298 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 PLXNB2O15031 1838 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 RAD21O60216 631 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 HMGCRP04035 888 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 RASA1P20936 1047 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 COG2Q14746 738 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 LBX2Q6XYB7 198 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 GPR142Q7Z601 462 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 BRCA2P51587 3418 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 SHISA4Q96DD7 197 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 BTBD7Q9P203 1132 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 PRDM1O75626 825 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 FLOT1O75955 427 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 GJA8P48165 433 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 GOPCQ9HD26 462 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 RGS2P41220 211 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 NUCB1Q02818 461 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 RILPL2Q969X0 211 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 DSG3P32926 999 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 PDE4BQ07343 736 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 PPARAQ07869 468 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 MORN1Q5T089 497 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 TRIB2Q92519 343 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 DEFB118Q96PH6 123 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 SGPL1O95470 568 aa21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 TRIM32Q13049 653 aa21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 PLS1Q14651 629 aa21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 ATG4CQ96DT6 458 aa21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 APBA2Q99767 749 aa21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 NYAP2Q9P242 653 aa21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 RLFQ13129 1914 aa21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 MAP2K5Q13163 448 aa21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 MB21D1Q8N884 522 aa21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 USP6NLQ92738 828 aa21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 FAM227BQ96M60 508 aa21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 A0A0D9SFI3 127 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 TSPY3P0CV98 308 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 TSPY8P0CW00 308 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 PTPREP23469 700 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 VPS53Q5VIR6 699 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 RPTORQ8N122 1335 aa21.89■■□□□ 1.1
NEDD1-208ENST00000555806 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 FOXP2O15409 715 aa21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 TICAM2Q86XR7 235 aa21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 CEP95Q96GE4 821 aa21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-208ENST00000555806 PARP14Q460N5 1801 aa21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms