RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 BCL11AQ9H165 835 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 MROH8Q9H579 483 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 ALPK3Q96L96 1907 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 ERCC3P19447 782 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 SHMT1P34896 483 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 GABPAQ06546 454 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 SHHQ15465 462 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 TRPV1Q8NER1 839 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 ACER1Q8TDN7 264 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 FAM161BQ96MY7 647 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 PLXNB2O15031 1838 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.29□□□□□ -1.08
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CS-233ENST00000552688 FCER1AP12319 257 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 GUCY1A2P33402 732 aa8.29□□□□□ -1.08
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CS-233ENST00000552688 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 ERC1Q8IUD2 1116 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 BADQ92934 168 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 SH2D4AQ9H788 454 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 SWAP70Q9UH65 585 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 COBLO75128 1261 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 RARBP10826 455 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 DSG3P32926 999 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 COPB2P35606 906 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 ADCYAP1R1P41586 468 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 SEPT2Q15019 361 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 LRRC41Q15345 812 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 TRIM60Q495X7 471 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 RNF180Q86T96 592 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 MAML3Q96JK9 1138 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 CCDC17Q96LX7 622 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 MCM9Q9NXL9 1143 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 PHF24Q9UPV7 400 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 TMX2Q9Y320 296 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-233ENST00000552688 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 A0A1W2PRG0 241 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 TRIM43BA6NCK2 446 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 APBB1O00213 710 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 KIAA0355O15063 1070 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 FLOT1O75955 427 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 CLTBP09497 229 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 MS4A1P11836 297 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 FOSL2P15408 326 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 RAG1P15918 1043 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 TLE2Q04725 743 aa8.27□□□□□ -1.09
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CS-233ENST00000552688 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.27□□□□□ -1.09
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CS-233ENST00000552688 TOX2Q96NM4 488 aa8.27□□□□□ -1.09
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CS-233ENST00000552688 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 VCPKMTQ9H867 229 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 SIPA1L1O43166 1804 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 SZT2Q5T011 3432 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.26□□□□□ -1.09
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CS-233ENST00000552688 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ANO1Q5XXA6 986 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 CEP85Q6P2H3 762 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 CCDC174Q6PII3 467 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 AACSQ86V21 672 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 NUP133Q8WUM0 1156 aa8.26□□□□□ -1.09
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