RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 CALML4Q96GE6 196 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 GBP5Q96PP8 586 aa7.02□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 OATP04181 439 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 ITGA6P23229 1130 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 ODR4Q5SWX8 454 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 SDF4Q9BRK5 362 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 PAGR1Q9BTK6 254 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 PRELID1Q9Y255 219 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 ATP8B2P98198 1209 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC10A4Q96EP9 437 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 UNC13BO14795 1591 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 ACTN2P35609 894 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 NEK11Q8NG66 645 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 Q4G0T1 1027 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 MCM9Q9NXL9 1143 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 NARFQ9UHQ1 456 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 STX8Q9UNK0 236 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 CARD8Q9Y2G2 431 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 KRT7P08729 469 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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