RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550672.5

SLC8B1-211, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC8B1, Length 2,925 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-211ENST00000550672 TFR2Q9UP52 801 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC8B1-211ENST00000550672 CASP1P29466 404 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC8B1-211ENST00000550672 CDC25AP30304 524 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC8B1-211ENST00000550672 MAP2K2P36507 400 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC8B1-211ENST00000550672 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SLC8B1-211ENST00000550672 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SLC8B1-211ENST00000550672 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC8B1-211ENST00000550672 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC8B1-211ENST00000550672 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC8B1-211ENST00000550672 MED15Q96RN5 788 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC8B1-211ENST00000550672 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC8B1-211ENST00000550672 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC8B1-211ENST00000550672 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC8B1-211ENST00000550672 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.77□□□□□ -0.04
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SLC8B1-211ENST00000550672 KRT40Q6A162 431 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.77□□□□□ -0.05
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SLC8B1-211ENST00000550672 KAT14Q9H8E8 782 aa14.77□□□□□ -0.05
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SLC8B1-211ENST00000550672 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.77□□□□□ -0.05
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SLC8B1-211ENST00000550672 ADD2P35612 726 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 NR1I3Q14994 352 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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SLC8B1-211ENST00000550672 FAM212AQ96EL1 285 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 CCDC172P0C7W6 258 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 ZNF18P17022 549 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.76□□□□□ -0.05
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SLC8B1-211ENST00000550672 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.054e-7■■■■□ 23.1
SLC8B1-211ENST00000550672 MYO6Q9UM54 1294 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 MYH7P12883 1935 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 EBAG9O00559 213 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 AFMP43652 599 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 STIM1Q13586 685 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 PTPAQ15257 358 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 BCAMP50895 628 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 PPARDQ03181 441 aa14.75□□□□□ -0.05
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SLC8B1-211ENST00000550672 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 TICAM2Q86XR7 235 aa14.75□□□□□ -0.05
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SLC8B1-211ENST00000550672 TRDNQ13061 729 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 H0YHG0 523 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 ZNF213O14771 459 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 PDE6AP16499 860 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 PARP10Q53GL7 1025 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 SPATA5Q8NB90 893 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 PANX2Q96RD6 677 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 COL4A1P02462 1669 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 TAF1P21675 1872 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 ERFEQ4G0M1 354 aa14.74□□□□□ -0.05
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SLC8B1-211ENST00000550672 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 SLC5A1P13866 664 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 INCENPQ9NQS7 918 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 PPP6R2O75170 966 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 MYBL2P10244 700 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 ANTXR2P58335 489 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 RASGRP2Q7LDG7 609 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 STAMQ92783 540 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 MMS19Q96T76 1030 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 MAP3K14Q99558 947 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 NBPF3Q9H094 633 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 SENP2Q9HC62 589 aa14.73□□□□□ -0.05
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