RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547541.1

TARBP2-208, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 430 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-208	ENST00000547541	GINM1	Q9NU53	330 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	CNTNAP1	P78357	1384 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	KLRF2	D3W0D1	207 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	GUCY1B3	Q02153	619 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	GALNT17	Q6IS24	598 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	MICALL2	Q8IY33	904 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	HOOK2	Q96ED9	719 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	SPATA32	Q96LK8	384 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	PPFIA3	O75145	1194 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	YEATS4	O95619	227 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	PDHB	P11177	359 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	SCG2	P13521	617 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	GUCY1A2	P33402	732 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	GSE1	Q14687	1217 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	AIFM3	Q96NN9	605 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	FIBP	O43427	364 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	CALML3	P27482	149 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	RASA3	Q14644	834 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	GPT2	Q8TD30	523 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	DCAF4	Q8WV16	495 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	SIPA1L1	O43166	1804 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	KRT2	P35908	639 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	FOSB	P53539	338 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF543	Q08ER8	600 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	TCHH	Q07283	1943 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	USP17L5	A8MUK1	530 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	BTBD18	B2RXH4	712 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	KIF28P	B7ZC32	967 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	CYTH3	O43739	400 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	PPP6R2	O75170	966 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	CAP2	P40123	477 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	ICA1	Q05084	483 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	SEPT2	Q15019	361 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	ANO1	Q5XXA6	986 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	GMCL1	Q96IK5	515 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	USP28	Q96RU2	1077 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-208	ENST00000547541	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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