RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527421.5

UBXN1-208, Transcript of UBX domain protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN1, Length 1,085 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1-208ENST00000527421 PRDM1O75626 825 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 SDSP20132 328 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 PDE4AP27815 886 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 FLT3LGP49771 235 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 MYH4Q9Y623 1939 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 PEX10O60683 326 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 GRK4P32298 578 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 ERVK-9P63128 1117 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 ERVK-24P63145 666 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 GOPCQ9HD26 462 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN1-208ENST00000527421 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 HIP1O00291 1037 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 LBX2Q6XYB7 198 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 PARP14Q460N5 1801 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 RLFQ13129 1914 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 IRF5Q13568 498 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 ALX1Q15699 326 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 ZMYM6O95789 1325 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 ADCY3O60266 1144 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 TSPY3P0CV98 308 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 TSPY8P0CW00 308 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 MAPK4P31152 587 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 CCNA1P78396 465 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 COG2Q14746 738 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 TTC22Q5TAA0 569 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 NYAP2Q9P242 653 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 PLXNB2O15031 1838 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 POTEFA5A3E0 1075 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 RAD21O60216 631 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 CNMDO75829 334 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 FLOT1O75955 427 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 Q3C1V9 767 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 CENPFP49454 3210 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 FGAP02671 866 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 UBXN2AP68543 259 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 CEP95Q96GE4 821 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 PORCNQ9H237 461 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 LAMA4Q16363 1823 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 ELNP15502 786 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 TFAP4Q01664 338 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 BTBD7Q9P203 1132 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN1-208ENST00000527421 TTLL1O95922 423 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 GPR142Q7Z601 462 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 MB21D1Q8N884 522 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 GJD2Q9UKL4 321 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 TSPY2A6NKD2 308 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 INHAP05111 366 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 DSG3P32926 999 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 MTFR1Q15390 333 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 WDR78Q5VTH9 848 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 F5H6K3 240 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 ORC4O43929 436 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 NDUFB10O96000 172 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 KLRC3Q07444 240 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UBXN1-208ENST00000527421 MKL1Q969V6 931 aa22.12■■□□□ 1.13
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