RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 COG2Q14746 738 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-211ENST00000513325 UBE3CQ15386 1083 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-211ENST00000513325 C12orf60Q5U649 245 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-211ENST00000513325 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-211ENST00000513325 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-211ENST00000513325 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-211ENST00000513325 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.4■□□□□ 0.86
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HERC3-211ENST00000513325 USP17L21D6R901 530 aa20.39■□□□□ 0.85
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HERC3-211ENST00000513325 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.39■□□□□ 0.85
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HERC3-211ENST00000513325 CDK8P49336 464 aa20.38■□□□□ 0.85
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HERC3-211ENST00000513325 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.38■□□□□ 0.85
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HERC3-211ENST00000513325 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.37■□□□□ 0.85
HERC3-211ENST00000513325 LPAR1Q92633 364 aa20.37■□□□□ 0.85
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HERC3-211ENST00000513325 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.36■□□□□ 0.85
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HERC3-211ENST00000513325 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.36■□□□□ 0.85
HERC3-211ENST00000513325 TMX2Q9Y320 296 aa20.36■□□□□ 0.85
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HERC3-211ENST00000513325 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.35■□□□□ 0.85
HERC3-211ENST00000513325 MYH8P13535 1937 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-211ENST00000513325 STRNO43815 780 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-211ENST00000513325 FLOT1O75955 427 aa20.34■□□□□ 0.85
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HERC3-211ENST00000513325 CNGA1P29973 690 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-211ENST00000513325 PLS1Q14651 629 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-211ENST00000513325 DPP9Q86TI2 863 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-211ENST00000513325 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-211ENST00000513325 ATG4CQ96DT6 458 aa20.34■□□□□ 0.85
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HERC3-211ENST00000513325 MB21D1Q8N884 522 aa20.33■□□□□ 0.85
HERC3-211ENST00000513325 DCTPP1Q9H773 170 aa20.33■□□□□ 0.85
HERC3-211ENST00000513325 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HERC3-211ENST00000513325 MYH7P12883 1935 aa20.33■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 IGHA2P01877 340 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 TRPV1Q8NER1 839 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 MSCO60682 206 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 COBLO75128 1261 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.31■□□□□ 0.84
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HERC3-211ENST00000513325 MROH8Q9H579 483 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 CYBAP13498 195 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 LRCH3Q96II8 777 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 SZT2Q5T011 3432 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 OSBP2Q969R2 916 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 GPATCH3Q96I76 525 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 GOPCQ9HD26 462 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 RAD21O60216 631 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 SBK1Q52WX2 424 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 APPBP2Q92624 585 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-211ENST00000513325 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.28■□□□□ 0.84
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