RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490127.5

RBM3-209, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 5

Gene RBM3, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-209	ENST00000490127	CNMD	O75829	334 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	MBD4	O95243	580 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	CHGB	P05060	677 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	MX1	P20591	662 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127		Q7L0L9	218 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-209	ENST00000490127	PTPRE	P23469	700 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	CNGA1	P29973	690 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	MSC	O60682	206 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	VCAM1	P19320	739 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	PRKAB2	O43741	272 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	PLCD1	P51178	756 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	LPAR1	Q92633	364 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	HOXC6	P09630	235 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	SHMT1	P34896	483 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	GABPA	Q06546	454 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	GRB14	Q14449	540 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	APPBP2	Q92624	585 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	CYP2D6	P10635	497 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	CYP2C19	P33261	490 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	EVX2	Q03828	476 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	COG2	Q14746	738 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	SEPT2	Q15019	361 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	DNM1L	O00429	736 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	STRN	O43815	780 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-209	ENST00000490127	GPAA1	O43292	621 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	IGHD	P01880	384 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	ADORA2A	P29274	412 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	PDE1A	P54750	535 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	RTP1	P59025	263 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127		A0A1W2PRG0	241 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	USP17L21	D6R901	530 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127		M0R2C6	588 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	CYBA	P13498	195 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	GNAT2	P19087	354 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-209	ENST00000490127	ERCC3	P19447	782 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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