RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 RBPJLQ9UBG7 517 aa28.95■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa28.95■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 MYH4Q9Y623 1939 aa28.94■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 COG2Q14746 738 aa28.94■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 PLIN4Q96Q06 1357 aa28.93■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 WDR46O15213 610 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 FGAP02671 866 aa28.93■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 ERVK-9P63128 1117 aa28.93■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 ERVK-24P63145 666 aa28.93■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 ATP2B2Q01814 1243 aa28.93■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 IRF5Q13568 498 aa28.93■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 CLEC10AQ8IUN9 316 aa28.93■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 NEDD1Q8NHV4 660 aa28.93■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 TSPY3P0CV98 308 aa28.92■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 TSPY8P0CW00 308 aa28.92■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 MAPK4P31152 587 aa28.92■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 CCNA1P78396 465 aa28.92■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 PRKCZQ05513 592 aa28.92■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 ZNF333Q96JL9 665 aa28.92■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 TANGO6Q9C0B7 1094 aa28.92■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa28.91■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 PRDM1O75626 825 aa28.91■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 GRK4P32298 578 aa28.91■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 SLAIN1Q8ND83 568 aa28.91■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 TXNRD2Q9NNW7 524 aa28.91■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.91■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 RLFQ13129 1914 aa28.9■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 PCP11498 1178 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 MB21D1Q8N884 522 aa28.9■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 PXYLP1Q8TE99 480 aa28.9■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 MKL1Q969V6 931 aa28.9■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 PAGR1Q9BTK6 254 aa28.9■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 MTMR4Q9NYA4 1195 aa28.9■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 HTTP42858 3142 aa28.89■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 ORC4O43929 436 aa28.89■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 TTLL1O95922 423 aa28.89■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 FGRP09769 529 aa28.89■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 FLT3LGP49771 235 aa28.89■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 SOX10P56693 466 aa28.89■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 TFAP4Q01664 338 aa28.89■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 GABRQQ9UN88 632 aa28.89■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 PARP14Q460N5 1801 aa28.88■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 CTDSPL2Q05D32 466 aa28.88■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa28.88■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 TMEM106CQ9BVX2 250 aa28.88■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 DSG3P32926 999 aa28.87■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 NT5C2P49902 561 aa28.87■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 Q3C1V9 767 aa28.87■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 SPICE1Q8N0Z3 855 aa28.87■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.87■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 CEP95Q96GE4 821 aa28.87■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 CLIP2Q9UDT6 1046 aa28.87■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 TSPY2A6NKD2 308 aa28.86■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 ADCY3O60266 1144 aa28.86■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 FLOT1O75955 427 aa28.86■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 UBXN2AP68543 259 aa28.86■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 SH3TC2Q8TF17 1288 aa28.86■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 SOCS4Q8WXH5 440 aa28.86■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 DSCC1Q9BVC3 393 aa28.86■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 RAD50Q92878 1312 aa28.86■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 CNMDO75829 334 aa28.85■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 POTEEQ6S8J3 1075 aa28.85■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 GJD2Q9UKL4 321 aa28.85■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 A0A0G2JMZ2 1700 aa28.84■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 F5H6K3 240 aa28.84■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 KLRC3Q07444 240 aa28.84■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 FAM47AQ5JRC9 791 aa28.84■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 NUDT12Q9BQG2 462 aa28.84■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 CTNNA3Q9UI47 895 aa28.84■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 PLXNB2O15031 1838 aa28.83■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 LAMA4Q16363 1823 aa28.83■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 RAD21O60216 631 aa28.83■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 PLEKHH3Q7Z736 793 aa28.83■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa28.83■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 BTBD7Q9P203 1132 aa28.83■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
EHD1-211ENST00000489379 AKNAD1Q5T1N1 836 aa28.82■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.82■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 GPR142Q7Z601 462 aa28.82■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 PORCNQ9H237 461 aa28.82■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa28.82■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 ZNF213O14771 459 aa28.81■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 PEX10O60683 326 aa28.81■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 NDUFB10O96000 172 aa28.81■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 NEFLP07196 543 aa28.81■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms