RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SEMA3EO15041 775 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SLFN13Q68D06 897 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 CCDC25Q86WR0 208 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 KIFAP3Q92845 792 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 LRRC45Q96CN5 670 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 STK24Q9Y6E0 443 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 MAGEA1P43355 309 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF75DP51815 510 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 TNNC1P63316 161 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 TUBB4BP68371 445 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 RDH13Q8NBN7 331 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 CLTCL1P53675 1640 aa14.88□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.87□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 PRR16Q569H4 304 aa14.87□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.87□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 ZMYM6O95789 1325 aa14.87□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 STAMBPO95630 424 aa14.87□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 CALCOCO2Q13137 446 aa14.87□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 FBXO11Q86XK2 927 aa14.87□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.87□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 APOA5Q6Q788 366 aa14.87□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 NELFBQ8WX92 580 aa14.87□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 CCDC17Q96LX7 622 aa14.87□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.87□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 E9PCH4 1651 aa14.87□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 TECP42680 631 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 PNOCQ13519 176 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 NEK8Q86SG6 692 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 ATG3Q9NT62 314 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 NUP58Q9BVL2 599 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 CLRN2A0PK11 232 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM232C9JQI7 657 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 NR1I2O75469 434 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 TUBBP07437 444 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SLC8A3P57103 927 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.86□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 OPA1O60313 960 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 CD19P15391 556 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 DNM2P50570 870 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 PPP1R7Q15435 360 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 GNPTABQ3T906 1256 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SASH1O94885 1247 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 RXRBP28702 533 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SULF1Q8IWU6 871 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 ARHGAP6O43182 974 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SCRN1Q12765 414 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 TSC1Q92574 1164 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 ADCY9O60503 1353 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SMIM23A6NLE4 172 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 FLOT1O75955 427 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 PTGDRQ13258 359 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 OSBP2Q969R2 916 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.85□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 EVCP57679 992 aa14.84□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 ASIC2Q16515 512 aa14.84□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF827Q17R98 1081 aa14.84□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.84□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 CSRNP1Q96S65 589 aa14.84□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.84□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 MADDQ8WXG6 1647 aa14.84□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 TSPOAP1O95153 1857 aa14.84□□□□□ -0.03
HDLBP-241ENST00000487169 PRKAB2O43741 272 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms