RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 IDI2Q9BXS1 227 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 CDC25BP30305 580 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 PKN1Q16512 942 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 SARM1Q6SZW1 724 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 FSIP1Q8NA03 581 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 STX8Q9UNK0 236 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 NOVP48745 357 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 GNAQP50148 359 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 GRM4Q14833 912 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 STK38Q15208 465 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 EHD4Q9H223 541 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 ANO10Q9NW15 660 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 NFIAQ12857 509 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 IQCB1Q15051 598 aa21.92■■□□□ 1.1
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SYF2-204ENST00000476231 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 MYH8P13535 1937 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 SPTLC2O15270 562 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 ZNF75DP51815 510 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 ANO1Q5XXA6 986 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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SYF2-204ENST00000476231 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 CLIC4Q9Y696 253 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.91■■□□□ 1.1
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SYF2-204ENST00000476231 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.9■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.9■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 BTBD18B2RXH4 712 aa21.9■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 CFAP100Q494V2 611 aa21.9■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 CEP95Q96GE4 821 aa21.9■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 MAD2L2Q9UI95 211 aa21.9■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
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SYF2-204ENST00000476231 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.89■■□□□ 1.09
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SYF2-204ENST00000476231 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.88■■□□□ 1.09
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SYF2-204ENST00000476231 SLC39A14Q15043 492 aa21.88■■□□□ 1.09
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SYF2-204ENST00000476231 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.88■■□□□ 1.09
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SYF2-204ENST00000476231 GMLQ99445 158 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.87■■□□□ 1.09
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SYF2-204ENST00000476231 RAD17O75943 681 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 CACNB3P54284 484 aa21.87■■□□□ 1.09
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SYF2-204ENST00000476231 JMYQ8N9B5 988 aa21.87■■□□□ 1.09
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SYF2-204ENST00000476231 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.87■■□□□ 1.09
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SYF2-204ENST00000476231 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.87■■□□□ 1.09
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SYF2-204ENST00000476231 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 SIPA1L1O43166 1804 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 KRT2P35908 639 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 TCP10Q12799 353 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.86■■□□□ 1.09
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