RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKLE1Q8NAG6 615 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 C12orf42Q96LP6 360 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 HAUS7Q99871 368 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 BTBD7Q9P203 1132 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 SWAP70Q9UH65 585 aa10.31□□□□□ -0.76
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SH3BP1-204ENST00000459646 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
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SH3BP1-204ENST00000459646 GPATCH3Q96I76 525 aa10.29□□□□□ -0.76
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SH3BP1-204ENST00000459646 LPAR1Q92633 364 aa10.26□□□□□ -0.77
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SH3BP1-204ENST00000459646 VCPKMTQ9H867 229 aa10.26□□□□□ -0.77
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SH3BP1-204ENST00000459646 PARP14Q460N5 1801 aa10.26□□□□□ -0.77
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SH3BP1-204ENST00000459646 SIAH1Q8IUQ4 282 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP1-204ENST00000459646 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP1-204ENST00000459646 ARRDC4Q8NCT1 418 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP1-204ENST00000459646 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP1-204ENST00000459646 LRCH3Q96II8 777 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP1-204ENST00000459646 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
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SH3BP1-204ENST00000459646 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
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