RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.14■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 LNPKQ9C0E8 428 aa25.14■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 VCPKMTQ9H867 229 aa25.14■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 HMGCRP04035 888 aa25.13■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 GJA8P48165 433 aa25.13■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 PLEKHH3Q7Z736 793 aa25.13■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.13■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 NAPBQ9H115 298 aa25.13■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 GOPCQ9HD26 462 aa25.13■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 GJD2Q9UKL4 321 aa25.13■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.12■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 SMIM22K7EJ46 135 aa25.11■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 Q3C1V9 767 aa25.11■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 GPR142Q7Z601 462 aa25.11■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 MB21D1Q8N884 522 aa25.11■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 UNC93B1Q9H1C4 597 aa25.11■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.11■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 PEX10O60683 326 aa25.1■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 RGS2P41220 211 aa25.1■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 PDE4BQ07343 736 aa25.1■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 WDR78Q5VTH9 848 aa25.1■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.1■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.1■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.1■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 PORCNQ9H237 461 aa25.1■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 FLOT1O75955 427 aa25.09■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 CYP2B6P20813 491 aa25.09■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 RASA1P20936 1047 aa25.09■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.09■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.09■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.09■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 PLXNB2O15031 1838 aa25.09■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.08■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 RAD21O60216 631 aa25.08■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 CNMDO75829 334 aa25.08■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
LTB-211ENST00000446745 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 SGPL1O95470 568 aa25.07■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 NUCB1Q02818 461 aa25.07■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 APBA2Q99767 749 aa25.07■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 BTBD7Q9P203 1132 aa25.07■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 NYAP2Q9P242 653 aa25.07■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.06■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 IGHDP01880 384 aa25.06■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 DSG3P32926 999 aa25.06■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 PPARAQ07869 468 aa25.06■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 MORN1Q5T089 497 aa25.06■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.06■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 DEFB118Q96PH6 123 aa25.06■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 RPTORQ8N122 1335 aa25.06■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 MAP2K5Q13163 448 aa25.05■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.05■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.05■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 RILPL2Q969X0 211 aa25.05■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 SHISA4Q96DD7 197 aa25.05■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.04■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 TSPY3P0CV98 308 aa25.04■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 TSPY8P0CW00 308 aa25.04■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 PTPREP23469 700 aa25.04■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.04■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.04■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.04■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 TRIB2Q92519 343 aa25.04■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 USP6NLQ92738 828 aa25.04■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.04■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.04■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 STRNO43815 780 aa25.03■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 PRDM1O75626 825 aa25.03■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 PLS1Q14651 629 aa25.03■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 HTATIP2Q9BUP3 242 aa25.03■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.03■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 MROH8Q9H579 483 aa25.03■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 RLFQ13129 1914 aa25.03■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 TTLL1O95922 423 aa25.02■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 ATG4CQ96DT6 458 aa25.02■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.02■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 MYH4Q9Y623 1939 aa25.02■■□□□ 1.6
LTB-211ENST00000446745 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
LTB-211ENST00000446745 GRB14Q14449 540 aa25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms