RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395713.6

TRPS1-202, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-202ENST00000395713 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.03□□□□□ -1.28
TRPS1-202ENST00000395713 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.03□□□□□ -1.28
TRPS1-202ENST00000395713 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.03□□□□□ -1.28
TRPS1-202ENST00000395713 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TRPS1-202ENST00000395713 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
TRPS1-202ENST00000395713 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TRPS1-202ENST00000395713 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
TRPS1-202ENST00000395713 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
TRPS1-202ENST00000395713 C9IYK1 514 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 SLC7A5Q01650 507 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 RNF43Q68DV7 783 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 FAM170BA6NMN3 283 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 F13BP05160 661 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 ETV3P41162 512 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 RASA3Q14644 834 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 NFE2L2Q16236 605 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 VWCEQ96DN2 955 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 SNTG2Q9NY99 539 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 PROCP04070 461 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 NFIAQ12857 509 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 NCAPHQ15003 741 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 BBS9Q3SYG4 887 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 ZNF765Q7L2R6 523 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 DEPDC7Q96QD5 511 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 MSTNO14793 375 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 LRRN2O75325 713 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 IGLV1-40P01703 118 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 CYP7A1P22680 504 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 RNF141Q8WVD5 230 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 FBXL18Q96ME1 805 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 ARHGEF11O15085 1522 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 CFTRP13569 1480 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 WDR64B1ANS9 1081 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 PDPK1O15530 556 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 CBX7O95931 251 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 FSTP19883 344 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 RNF4P78317 190 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 DCAF15Q66K64 600 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 ASPNQ9BXN1 380 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 PRR33A8MZF0 331 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 CYP27A1Q02318 531 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 RASGRF1Q13972 1273 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 Q96M66 194 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-202ENST00000395713 SUSD5O60279 629 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-202ENST00000395713 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-202ENST00000395713 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-202ENST00000395713 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-202ENST00000395713 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-202ENST00000395713 HAUS7Q99871 368 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-202ENST00000395713 ATG3Q9NT62 314 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-202ENST00000395713 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-202ENST00000395713 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-202ENST00000395713 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-202ENST00000395713 SHOXO15266 292 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-202ENST00000395713 GSC2O15499 205 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-202ENST00000395713 CBFA2T2O43439 604 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-202ENST00000395713 DYRK3O43781 588 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms