RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 RASA3Q14644 834 aa23.56■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 PKN1Q16512 942 aa23.56■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.56■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.56■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 GNAQP50148 359 aa23.55■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 MAP3K10Q02779 954 aa23.55■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 KRT40Q6A162 431 aa23.55■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.55■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 HACL1Q9UJ83 578 aa23.55■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.55■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.54■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.54■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 TEPSINQ96N21 525 aa23.54■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.54■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 GDF11O95390 407 aa23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 SNHG28P0DPA3 235 aa23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 RASGRP2Q7LDG7 609 aa23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 PDHBP11177 359 aa23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 JAG1P78504 1218 aa23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 SEPT2Q15019 361 aa23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 MKL1Q969V6 931 aa23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 NYAP2Q9P242 653 aa23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 MTMR7Q9Y216 660 aa23.53■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 TRAK2O60296 914 aa23.52■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 EPS15P42566 896 aa23.52■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.52■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.52■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 KRT85P78386 507 aa23.51■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM29Q14134 588 aa23.51■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.51■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.51■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 USP17L5A8MUK1 530 aa23.51■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 GH2P01242 217 aa23.51■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.5■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 CYTH3O43739 400 aa23.5■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.5■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 ICA1Q05084 483 aa23.5■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.5■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 USP48Q86UV5 1035 aa23.5■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 SHISA4Q96DD7 197 aa23.5■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.5■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 CABP5Q9NP86 173 aa23.5■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 KIF28PB7ZC32 967 aa23.49■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 KLRF2D3W0D1 207 aa23.49■■□□□ 1.35
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HDDC3-202ENST00000394272 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.49■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 FIBPO43427 364 aa23.49■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 MMP1P03956 469 aa23.49■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 ATP2B2Q01814 1243 aa23.49■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.49■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 BRAPQ7Z569 592 aa23.49■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 GPR162Q16538 588 aa23.48■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 SCG2P13521 617 aa23.47■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.47■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.47■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.47■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.47■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 XBP1P17861 261 aa23.47■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF543Q08ER8 600 aa23.47■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 ATL3Q6DD88 541 aa23.47■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 CAP2P40123 477 aa23.46■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.46■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.46■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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HDDC3-202ENST00000394272 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.46■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.45■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.45■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 CPVLQ9H3G5 476 aa23.45■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 CFAP45Q9UL16 551 aa23.45■■□□□ 1.35
HDDC3-202ENST00000394272 ELP1O95163 1332 aa23.45■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 GRIN3BO60391 1043 aa23.45■■□□□ 1.34
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