RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C18orf65Q6ZTR6 163 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IL17RELQ6ZVW7 336 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF721Q8TF20 911 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TEKT5Q96M29 485 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BOCQ9BWV1 1114 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 REEP1Q9H902 201 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APEX2Q9UBZ4 518 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A0A0MRY4 1105 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCO2A0A1W2PP80 73 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EPOPA6NHQ4 379 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H0YL77 283 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNFRSF6BO95407 300 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LIG1P18858 919 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VEGFBP49765 207 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IL9RQ01113 521 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FOXK2Q01167 660 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT24Q2M2I5 525 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AP5B1Q2VPB7 878 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LMOD2Q6P5Q4 547 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPINK6Q6UWN8 80 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM108Q6UXF1 575 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMPRSS12Q86WS5 348 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NUTM1Q86Y26 1132 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT73Q86Y46 540 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRR26Q8N8Z3 221 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DBF4BQ8NFT6 615 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CXorf38Q8TB03 319 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PHKBQ93100 1093 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SHISA4Q96DD7 197 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MED15Q96RN5 788 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DMRTA2Q96SC8 542 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANAPC11Q9NYG5 84 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLAGL1Q9UM63 463 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TAF6LQ9Y6J9 622 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GRIN2DO15399 1336 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC78A2IDD5 438 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 J3QW42 95 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EFSO43281 561 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DIAPH2O60879 1101 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WNT11O96014 354 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPINK1P00995 79 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C8AP07357 584 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HOXB7P09629 217 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SSFA2P28290 1259 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TIMP3P35625 211 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IST1P53990 364 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GRB7Q14451 532 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNPTABQ3T906 1256 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM259Q4ZIN3 620 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UTF1Q5T230 341 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF44Q7L0R7 432 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPC2Q8N158 579 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADAMTS15Q8TE58 950 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXO41Q8TF61 875 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RUNDC1Q96C34 613 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MRIQ9BWK5 157 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZFP64Q9NPA5 681 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNFRSF19Q9NS68 423 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KNL1Q8NG31 2342 aa-2.47□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSPOAP1O95153 1857 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NID2Q14112 1375 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 USP31Q70CQ4 1352 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A0G2JQZ4 141 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIR2DS3K7RE56 304 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GABBR2O75899 941 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CSPG5O95196 566 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TAF6P49848 677 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NFIAQ12857 509 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIR2DS3Q14952 304 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SWI5Q1ZZU3 235 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP4R3AQ6IN85 833 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q6ZS46 218 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RFX6Q8HWS3 928 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC16A11Q8NCK7 471 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa-2.48□□□□□ -2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms