RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 CCL5P13501 91 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 ELNP15502 786 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 GNAT2P19087 354 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 TDO2P48775 406 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 ERVK-9P63128 1117 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 ERVK-24P63145 666 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 UBXN2AP68543 259 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 IRF5Q13568 498 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 SBK1Q52WX2 424 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC17Q96LX7 622 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 SH2D4AQ9H788 454 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.17□□□□□ -0.94
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SGMS1-201ENST00000361543 MAPK4P31152 587 aa9.16□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 PDE1AP54750 535 aa9.16□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.16□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.16□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 SMC5Q8IY18 1101 aa9.16□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.16□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.16□□□□□ -0.94
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SGMS1-201ENST00000361543 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.16□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.16□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 CNMDO75829 334 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 HMGCRP04035 888 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 RASA1P20936 1047 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 CCNA1P78396 465 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 ATP2B2Q01814 1243 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 LBX2Q6XYB7 198 aa9.15□□□□□ -0.94
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SGMS1-201ENST00000361543 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 SOCS4Q8WXH5 440 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 LPAR1Q92633 364 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 EVI5LQ96CN4 794 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 SHISA4Q96DD7 197 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 NACAP1Q9BZK3 213 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 RNF208Q9H0X6 261 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.15□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 PORCNQ9H237 461 aa9.15□□□□□ -0.94
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SGMS1-201ENST00000361543 Q3C1V9 767 aa9.14□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa9.14□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa9.14□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.14□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.14□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.14□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 COG2Q14746 738 aa9.13□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 TRIB2Q92519 343 aa9.13□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 APBA2Q99767 749 aa9.13□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 GOPCQ9HD26 462 aa9.13□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 HOXC10Q9NYD6 342 aa9.13□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 BTBD7Q9P203 1132 aa9.13□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0D9SFI3 127 aa9.12□□□□□ -0.95
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