RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361219.10

SERBP1-201, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERBP1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-201ENST00000361219 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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SERBP1-201ENST00000361219 FBXW7Q969H0 707 aa23■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 BIN1O00499 593 aa23■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 CNNM3Q8NE01 707 aa23■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 KCNF1Q9H3M0 494 aa23■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 MAD2L2Q9UI95 211 aa23■■□□□ 1.27
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SERBP1-201ENST00000361219 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.99■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.99■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 EYA3Q99504 573 aa22.99■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.99■■□□□ 1.27
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SERBP1-201ENST00000361219 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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SERBP1-201ENST00000361219 TRAPPC10P48553 1259 aa22.97■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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SERBP1-201ENST00000361219 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 CSRNP2Q9H175 543 aa22.97■■□□□ 1.27
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SERBP1-201ENST00000361219 TTC38Q5R3I4 469 aa22.96■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 FERMT2Q96AC1 680 aa22.96■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 WNT7AO00755 349 aa22.96■■□□□ 1.27
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SERBP1-201ENST00000361219 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.96■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.96■■□□□ 1.27
SERBP1-201ENST00000361219 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SERBP1-201ENST00000361219 RXRBP28702 533 aa22.95■■□□□ 1.26
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SERBP1-201ENST00000361219 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.95■■□□□ 1.26
SERBP1-201ENST00000361219 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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SERBP1-201ENST00000361219 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.94■■□□□ 1.26
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SERBP1-201ENST00000361219 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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SERBP1-201ENST00000361219 SMTNL1A8MU46 457 aa22.94■■□□□ 1.26
SERBP1-201ENST00000361219 CYTH3O43739 400 aa22.94■■□□□ 1.26
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SERBP1-201ENST00000361219 BLIDQ8IZY5 108 aa22.93■■□□□ 1.26
SERBP1-201ENST00000361219 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
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SERBP1-201ENST00000361219 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SERBP1-201ENST00000361219 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
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SERBP1-201ENST00000361219 ZNF174Q15697 407 aa22.93■■□□□ 1.26
SERBP1-201ENST00000361219 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.93■■□□□ 1.26
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SERBP1-201ENST00000361219 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.93■■□□□ 1.26
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SERBP1-201ENST00000361219 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.92■■□□□ 1.26
SERBP1-201ENST00000361219 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.92■■□□□ 1.26
SERBP1-201ENST00000361219 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.262e-11■□□□□ 11.2
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SERBP1-201ENST00000361219 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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SERBP1-201ENST00000361219 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.91■■□□□ 1.26
SERBP1-201ENST00000361219 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.91■■□□□ 1.26
SERBP1-201ENST00000361219 MXD3Q9BW11 206 aa22.91■■□□□ 1.26
SERBP1-201ENST00000361219 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
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