RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358966.6

GGPS1-202, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GGPS1, Length 2,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-202ENST00000358966 TTLL6Q8N841 843 aa14.57□□□□□ -0.08
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GGPS1-202ENST00000358966 TSPY26PQ9H489 355 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-202ENST00000358966 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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GGPS1-202ENST00000358966 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.57□□□□□ -0.08
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GGPS1-202ENST00000358966 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
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GGPS1-202ENST00000358966 CALM3P0DP25 149 aa14.52□□□□□ -0.09
GGPS1-202ENST00000358966 PSEN1P49768 467 aa14.52□□□□□ -0.09
GGPS1-202ENST00000358966 PLCB2Q00722 1185 aa14.52□□□□□ -0.09
GGPS1-202ENST00000358966 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
GGPS1-202ENST00000358966 CFAP100Q494V2 611 aa14.52□□□□□ -0.09
GGPS1-202ENST00000358966 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.52□□□□□ -0.09
GGPS1-202ENST00000358966 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.52□□□□□ -0.09
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