RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 HOXD10P28358 340 aa14.46□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.46□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 MB21D1Q8N884 522 aa14.46□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.46□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 ACER1Q8TDN7 264 aa14.46□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TFAP4Q01664 338 aa14.45□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 COG2Q14746 738 aa14.45□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 ESR2Q92731 530 aa14.45□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 MAP4K1Q92918 833 aa14.45□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 EFCC1Q9HA90 598 aa14.45□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.45□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 LAMA4Q16363 1823 aa14.44□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TSPY2A6NKD2 308 aa14.44□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 SMIM22K7EJ46 135 aa14.44□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 FDX1P10109 184 aa14.44□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 CYP2C8P10632 490 aa14.44□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 HERVK_113P62684 666 aa14.44□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.44□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.44□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 KRT23Q9C075 422 aa14.44□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 PLA2G6O60733 806 aa14.43□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 CDC45O75419 566 aa14.43□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 FCGRTP55899 365 aa14.43□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 CCNA1P78396 465 aa14.43□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.43□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.43□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 CEP95Q96GE4 821 aa14.43□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.43□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 F5H6K3 240 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 PRDM1O75626 825 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 KLRC3Q07444 240 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 DGKZQ13574 1117 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 IQCA1Q86XH1 822 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 DGKHQ86XP1 1220 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 ANKS1AQ92625 1134 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 ABHD8Q96I13 439 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 GMCL1Q96IK5 515 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 MTA3Q9BTC8 594 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 CPA4Q9UI42 421 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 CENPFP49454 3210 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 CAPN2P17655 700 aa14.41□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 MAPK4P31152 587 aa14.41□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 COPB2P35606 906 aa14.41□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TRDNQ13061 729 aa14.41□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.41□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.41□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 NBPF3Q9H094 633 aa14.41□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.41□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 DSG3P32926 999 aa14.4□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 PSMC4P43686 418 aa14.4□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 ERVK-9P63128 1117 aa14.4□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 ERVK-24P63145 666 aa14.4□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 IRF5Q13568 498 aa14.4□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.4□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 IL25Q9H293 177 aa14.4□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.4□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.4□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 SRRDQ9UH36 339 aa14.4□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.4□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TRIM17Q9Y577 477 aa14.4□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 MYH4Q9Y623 1939 aa14.4□□□□□ -0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 NDUFB10O96000 172 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 HAND2P61296 217 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 ATP2B2Q01814 1243 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF20Q5VTR2 975 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 COA7Q96BR5 231 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 TRIM47Q96LD4 638 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 FEM1BQ9UK73 627 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 PNMA2Q9UL42 364 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 STX8Q9UNK0 236 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 ATP2A1O14983 1001 aa14.38□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 STRNO43815 780 aa14.38□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 FLOT1O75955 427 aa14.38□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 CYP21A2P08686 494 aa14.38□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 OAZ1P54368 228 aa14.38□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 PTH1RQ03431 593 aa14.38□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.38□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 NBPF11Q86T75 865 aa14.38□□□□□ -0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM160B2Q86V87 743 aa14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms