RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 NXNQ6DKJ4 435 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF365Q70YC5 407 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 HELLSQ9NRZ9 838 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 DEXIO95424 95 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 OSBPP22059 807 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC12A1Q13621 1099 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM50Q86XT4 487 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF217Q8TC41 542 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 TNFAIP1Q13829 316 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 A2MP01023 1474 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 CASP2P42575 452 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 GNPTABQ3T906 1256 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 NLRP7Q8WX94 980 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 RMDN2Q96LZ7 410 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 CSRNP1Q96S65 589 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 NUB1Q9Y5A7 615 aa13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 SCYL1Q96KG9 808 aa13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 PLCD1P51178 756 aa13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 SMYD2Q9NRG4 433 aa13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 RLBP1P12271 317 aa13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 ERFEQ4G0M1 354 aa13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 KRT27Q7Z3Y8 459 aa13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 GPBP1Q86WP2 473 aa13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 PLEKHG3A1L390 1219 aa13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 CAPN15O75808 1086 aa13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 POLR2MP0CAP2 368 aa13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 PSTPIP2Q9H939 334 aa13.15□□□□□ -0.3
UBASH3B-201ENST00000284273 USP19O94966 1318 aa13.15□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 RPS6KB1P23443 525 aa13.15□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF131P52739 623 aa13.15□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC12A2P55011 1212 aa13.15□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 SPAG1Q07617 926 aa13.15□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 GCKRQ14397 625 aa13.15□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 CEP85LQ5SZL2 805 aa13.15□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 C21orf2O43822 256 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 KCTD2Q14681 263 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 LLGL1Q15334 1064 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 DCAF15Q66K64 600 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 ARMC9Q7Z3E5 817 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 ICA1Q05084 483 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 PPARAQ07869 468 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 CEP57Q86XR8 500 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 CETN3O15182 167 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 NEMFO60524 1076 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 UBN1Q9NPG3 1134 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 ASAP1Q9ULH1 1129 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 CHMLP26374 656 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 ABCB5Q2M3G0 1257 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 ADPGKQ9BRR6 497 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1W2PP64 1363 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 IL1RL1Q01638 556 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 IGSF22Q8N9C0 903 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 MTRQ99707 1265 aa13.14□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 VAMP4O75379 141 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 PIK3CAP42336 1068 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKS4BQ8N8V4 417 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 IGSF3O75054 1194 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 IFNB1P01574 187 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 TNNC2P02585 160 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 CRKLP46109 303 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 NSD2O96028 1365 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 CTAGE3PQ8IX95 158 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 CHURC1Q8WUH1 139 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC10A4Q96EP9 437 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 TYW1BQ6NUM6 668 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 NELFBQ8WX92 580 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 VPS37BQ9H9H4 285 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 TTC41PQ6P2S7 1318 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 DYNC1I1O14576 645 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 P4HA1P13674 534 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 CHRNDQ07001 517 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC170Q8IYT3 715 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 C7orf31Q8N865 590 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 RSAD2Q8WXG1 361 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 PALD1Q9ULE6 856 aa13.13□□□□□ -0.31
UBASH3B-201ENST00000284273 TRPM2O94759 1503 aa13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms