RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Phactr2B1AVP0 632 aa25.58■■□□□ 1.69
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa25.58■■□□□ 1.69
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa25.58■■□□□ 1.69
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Leng1Q9DB98 261 aa25.58■■□□□ 1.69
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa25.58■■□□□ 1.69
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp50Q6P8X6 390 aa25.49■■□□□ 1.67
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tdrd1Q99MV1 1172 aa25.47■■□□□ 1.67
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp14Q9JMA1 493 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prkab1Q9R078 270 aa25.47■■□□□ 1.67
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Suclg2Q9Z2I8 433 aa25.47■■□□□ 1.67
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fgfr2P21803 821 aa25.46■■□□□ 1.67
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 YdjcQ14BV6 310 aa25.46■■□□□ 1.67
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmtc2Q56A06 836 aa25.46■■□□□ 1.67
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf784Q8BI69 297 aa25.46■■□□□ 1.67
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc7Q9D541 371 aa25.46■■□□□ 1.67
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