Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,06■■■■■ 4,8
Hoxd10P28359 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41,9■■■■■ 4,3
Hoxd10P28359 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,36■■■■■ 4,21
Hoxd10P28359 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,3■■■■□ 3,88
Hoxd10P28359 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,88■■■■□ 3,81
Hoxd10P28359 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Hoxd10P28359 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,09■■■■□ 3,69
Hoxd10P28359 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,02■■■■□ 3,68
Hoxd10P28359 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,85■■■■□ 3,65
Hoxd10P28359 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,64■■■■□ 3,62
Hoxd10P28359 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Hoxd10P28359 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,83■■■■□ 3,49
Hoxd10P28359 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,56■■■■□ 3,44
Hoxd10P28359 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Hoxd10P28359 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,39■■■■□ 3,42
Hoxd10P28359 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Hoxd10P28359 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Hoxd10P28359 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,09■■■■□ 3,37
Hoxd10P28359 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,89■■■■□ 3,34
Hoxd10P28359 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Hoxd10P28359 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Hoxd10P28359 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,71■■■■□ 3,31
Hoxd10P28359 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Hoxd10P28359 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Hoxd10P28359 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Hoxd10P28359 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Hoxd10P28359 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Hoxd10P28359 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Hoxd10P28359 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,82■■■■□ 3,17
Hoxd10P28359 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Hoxd10P28359 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,63■■■■□ 3,13
Hoxd10P28359 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,63■■■■□ 3,13
Hoxd10P28359 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,59■■■■□ 3,13
Hoxd10P28359 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,55■■■■□ 3,12
Hoxd10P28359 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,52■■■■□ 3,12
Hoxd10P28359 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Hoxd10P28359 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Hoxd10P28359 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Hoxd10P28359 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Hoxd10P28359 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Hoxd10P28359 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,13■■■■□ 3,05
Hoxd10P28359 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,11■■■■□ 3,05
Hoxd10P28359 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Hoxd10P28359 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
Hoxd10P28359 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,96■■■■□ 3,03
Hoxd10P28359 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Hoxd10P28359 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Hoxd10P28359 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Hoxd10P28359 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,74■■■□□ 2,99
Hoxd10P28359 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Hoxd10P28359 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Hoxd10P28359 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Hoxd10P28359 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Hoxd10P28359 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,6■■■□□ 2,97
Hoxd10P28359 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Hoxd10P28359 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Hoxd10P28359 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Hoxd10P28359 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Hoxd10P28359 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Hoxd10P28359 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Hoxd10P28359 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Hoxd10P28359 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Hoxd10P28359 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Hoxd10P28359 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Hoxd10P28359 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Hoxd10P28359 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Hoxd10P28359 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Hoxd10P28359 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Hoxd10P28359 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Hoxd10P28359 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,77■■■□□ 2,84
Hoxd10P28359 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32,77■■■□□ 2,84
Hoxd10P28359 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Hoxd10P28359 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Hoxd10P28359 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,7■■■□□ 2,83
Hoxd10P28359 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Hoxd10P28359 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Hoxd10P28359 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Hoxd10P28359 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Hoxd10P28359 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32,61■■■□□ 2,81
Hoxd10P28359 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32,47■■■□□ 2,79
Hoxd10P28359 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,43■■■□□ 2,78
Hoxd10P28359 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Hoxd10P28359 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,39■■■□□ 2,78
Hoxd10P28359 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Hoxd10P28359 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Hoxd10P28359 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Hoxd10P28359 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32,37■■■□□ 2,77
Hoxd10P28359 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Hoxd10P28359 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,26■■■□□ 2,75
Hoxd10P28359 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Hoxd10P28359 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Hoxd10P28359 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32,14■■■□□ 2,74
Hoxd10P28359 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Hoxd10P28359 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Hoxd10P28359 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,08■■■□□ 2,73
Hoxd10P28359 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Hoxd10P28359 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Hoxd10P28359 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Hoxd10P28359 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Hoxd10P28359 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56,7 ms