RNA–Protein interactions for RNA: YOR104W

PIN2, Transcript of Exomer-dependent cargo protein, yeast

Gene PIN2, Length 849 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIN2	YOR104W	ARG2	P40360	574 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	MRX6	P48564	524 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	UFO1	Q04511	668 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	THI7	Q05998	598 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	BSP1	Q06604	576 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	AIM41	Q12032	185 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	SEY1	Q99287	776 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	SLY1	P22213	666 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	PPH22	P23595	377 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	SEC6	P32844	805 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	YHR219W	P38900	624 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	VAC8	P39968	578 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	BST1	P43571	1029 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	YJL132W	P47014	750 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	HLJ1	P48353	224 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	MAL13	P53338	473 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	YNR063W	P53749	607 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	GRX8	Q05926	109 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	SGO1	Q08490	590 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	IZH4	Q99393	312 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	STE11	P23561	717 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	PPZ1	P26570	692 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	CNS1	P33313	385 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	FUI1	P38196	639 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	END3	P39013	349 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	GYP8	P43570	497 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	NNF1	P47149	201 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	TCB2	P48231	1178 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	RFX1	P48743	811 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	COQ6	P53318	479 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	VPS9	P54787	451 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	BET4	Q00618	327 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	SEG1	Q04279	960 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	ECI1	Q05871	280 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	YDR018C	Q12185	396 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	LCB4	Q12246	624 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	SGF29	P25554	259 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	AIM18	P38884	321 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	STL1	P39932	569 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	YMR134W	P40207	237 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	CNN1	P43618	361 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	RSM26	P47141	266 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	SFB2	P53953	876 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	ARA2	Q04212	335 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	VTI1	Q04338	217 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	DAL4	Q04895	635 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	YLR012C	Q07927	99 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	AAD15	Q08361	143 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	GPM3	Q12326	303 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	HIS5	P07172	385 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	ADY2	P25613	283 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	ADD66	P36040	267 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	BIT2	P38346	545 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	MMS21	P38632	267 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	HSE1	P38753	452 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	FLC2	P39719	783 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	UBP7	P40453	1071 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	MND2	P40577	368 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	PCL10	P53124	433 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	RIM8	P53179	542 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	YNL144C	P53907	740 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	YPL014W	Q02606	381 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	INA17	Q02888	182 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	PIR3	Q03180	325 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PIN2	YOR104W	URH1	Q04179	340 aa		5.66	□□□□□ -1.5

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