RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	SFL1	P20134	766 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SLY1	P22213	666 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	LYP1	P32487	611 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SLA2	P33338	968 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MCM7	P38132	845 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	HSL7	P38274	827 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MSG5	P38590	489 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MMS21	P38632	267 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MEF2	P39677	819 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	YMR134W	P40207	237 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	ARG2	P40360	574 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	TMA108	P40462	946 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	YIL054W	P40524	105 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MPH1	P40562	993 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	OPT1	P40897	799 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	POL31	P46957	487 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	YJR039W	P47107	1121 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	PCL10	P53124	433 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	PUS2	P53167	370 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	RSM24	Q03976	319 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SND1	Q04007	877 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
TRM10	YOL093W	DDC1	Q08949	612 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	VPS54	Q12071	889 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	RMP1	Q12530	201 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	APM4	Q99186	491 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	TAO3	P40468	2376 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	QCR6	P00127	147 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	LAM1	P38851	1228 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	INA22	P40576	216 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SNM1	P40993	198 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	TDA9	Q04545	1251 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	THI7	Q05998	598 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	OMS1	Q06668	471 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	YLL056C	Q12177	298 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	HRT3	Q12347	344 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	PRC1	P00729	532 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	PGS1	P25578	521 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MEI4	P29467	408 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	PLC1	P32383	869 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	VHC1	P38329	1120 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	PRM9	P39551	298 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SAW1	P39735	261 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	ASG1	P40467	964 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	YJL132W	P47014	750 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	ZAP1	P47043	880 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	YJR079W	P47126	109 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	VPS9	P54787	451 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SPO20	Q04359	397 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	AAD15	Q08361	143 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	YDR018C	Q12185	396 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SVS1	Q12254	260 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SEY1	Q99287	776 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	RAD1	P06777	1100 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	CLN2	P20438	545 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	BAS1	P22035	811 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	SYN8	P31377	255 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	PEX5	P35056	612 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	CKB2	P38930	258 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	ERP2	P39704	215 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	MND2	P40577	368 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	MIC19	P43594	170 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	TCB2	P48231	1178 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	RTA1	P53047	317 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	TYW3	P53177	273 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	DOS2	P54858	310 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	SHR3	Q02774	210 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	HRD3	Q05787	833 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	GRX8	Q05926	109 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	STE23	Q06010	1027 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	ACM1	Q08981	209 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	HOS1	Q12214	470 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	ARP7	Q12406	477 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	AHC1	Q12433	566 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	IZH4	Q99393	312 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	ADH4	P10127	382 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	MRPL25	P23369	157 aa		5.01	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 88.5 ms