RNA–Protein interactions for RNA: YOL013C

HRD1, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeastyeast

Gene HRD1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1YOL013C GET2P40056 285 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C CAB2P40506 365 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C GSM1P42950 618 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C NOP9P47077 666 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C ENP2P48234 707 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TAM41P53230 385 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C ART5P53244 586 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C BNI5P53890 448 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TLG1Q03322 224 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C STP3Q05937 343 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C HOS1Q12214 470 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C SUL2Q12325 893 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C NDJ1Q12366 352 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TY1B-DR4Q07793 1604 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TY2A-LR1P0C2J4 438 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TY2A-FP0CX61 438 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TY2A-GR2P0CX62 438 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C HMG2P12684 1045 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C CBS1P14066 229 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TY2A-CP25383 438 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C CWH43P25618 953 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C PRE4P30657 266 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C YPT7P32939 208 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C UBP13P38187 747 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C BDH2P39713 417 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C EFM4P40516 257 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C ARC1P46672 376 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C YDL183CP48569 320 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C SQS1P53866 767 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C SEC5P89102 971 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C CIK1Q01649 594 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C YPL107WQ02873 248 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TY2A-DR2Q03483 438 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C CRD1Q07560 283 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TY2A-BQ12260 438 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TY2A-OR2Q12293 438 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TY2A-DR1Q12392 438 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TY2A-OR1Q12439 438 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TY2A-DR3Q99303 438 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C ISN1Q99312 450 aa3.52□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C BIK1P11709 440 aa3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C STE12P13574 688 aa3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C ERG8P24521 451 aa3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C PET127P32606 800 aa3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C RFC1P38630 861 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C RTS1P38903 757 aa3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C SKP2P42843 763 aa3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C ZIM17P42844 174 aa3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C CCT7P42943 550 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C LCL3P53153 274 aa3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C MDR1P53258 950 aa3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C APM1Q00776 475 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C LGE1Q02796 332 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C MLH3Q12083 715 aa3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C NMD4Q12129 218 aa3.51□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C RPN13O13563 156 aa3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TUB1P09733 447 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C VMA2P16140 517 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C CLB1P24868 471 aa3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C ALY1P36117 915 aa3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C LAS1P36146 502 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C EHT1P38295 451 aa3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C FTH1P38310 465 aa3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C GND1P38720 489 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C UTP9P38882 575 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C SMF1P38925 575 aa3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C MET18P40469 1032 aa3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C CSL4P53859 292 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TIM11P81449 96 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C TRS31Q03337 283 aa3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C RSF1Q05043 376 aa3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C VAM6Q07468 1049 aa3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C FMP45Q07651 309 aa3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C ECM3Q99252 613 aa3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C YRF1-4O13559 1382 aa3.5□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C ABF1P14164 731 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C REC107P21651 314 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C SPO11P23179 398 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C PRP28P23394 588 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C OCA4P25366 362 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C POL4P25615 582 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C ERV1P27882 189 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C MGM1P32266 881 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C PUP2P32379 260 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C RIX1P38883 763 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C FLC2P39719 783 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C JHD1P40034 492 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C PIG2P40187 538 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C NAS2P40555 220 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.49□□□□□ -1.85not detected
HRD1YOL013C IST3P40565 148 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C PXA1P41909 870 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C ZAP1P47043 880 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C ATG21Q02887 496 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C RCO1Q04779 684 aa3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C HEL2Q05580 639 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HRD1YOL013C RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
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