RNA–Protein interactions for RNA: YLR449W

FPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase), yeast

Gene FPR4, Length 1,179 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FPR4	YLR449W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FPR4	YLR449W	YIR016W	P40572	265 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FPR4	YLR449W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FPR4	YLR449W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FPR4	YLR449W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FPR4	YLR449W	PEX15	Q08215	383 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FPR4	YLR449W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FPR4	YLR449W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FPR4	YLR449W	RMD5	Q12508	421 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FPR4	YLR449W	VPS13	Q07878	3144 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	SGE1	P33335	543 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	TSC10	P38342	320 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	HOS4	P40480	1083 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	MIG2	P53035	382 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	PET117	Q02771	107 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	YOL019W	Q08157	551 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	GNT1	Q12096	491 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	SPE1	P08432	466 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	IDI1	P15496	288 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	MLS1	P30952	554 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	HAT2	P39984	401 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	ILM1	P47155	203 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	COQ6	P53318	479 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	IPI3	P53877	555 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	EFM6	P53970	246 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	SPP2	Q02521	185 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	YPL014W	Q02606	381 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	RHO2	P06781	192 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	MIH1	P23748	554 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	YSP3	P25036	478 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	TOM20	P35180	183 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	FRT2	P39734	528 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	YNR063W	P53749	607 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	YMR155W	Q03795	547 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	SPO71	Q03868	1245 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	YIG1	Q08956	461 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	PDE1	P22434	369 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	VAN1	P23642	535 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	MRM1	P25270	412 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	OXP1	P28273	1286 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	KTR4	P38131	464 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	FMP10	P40098	244 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	AXL1	P40851	1208 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	USE1	P53146	245 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	TIM13	P53299	105 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	RPN4	Q03465	531 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	ENT4	Q07872	247 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	HMG2	P12684	1045 aa		13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	MRPL8	P22353	238 aa		13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	CTF13	P35203	478 aa		13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	BZZ1	P38822	633 aa		13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	PET130	P47065	347 aa		13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	YTP1	P53584	459 aa		13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	TRE2	Q08693	809 aa		13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	YOR387C	Q08910	206 aa		13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	APC9	Q12107	265 aa		13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	STB3	Q12427	513 aa		13.04	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	GUT2	P32191	649 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	AEP1	P32493	518 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	MRPL40	P36534	297 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	VRP1	P37370	817 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	ALG5	P40350	334 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	SLM2	P53955	656 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	DOS2	P54858	310 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	YCS4	Q06156	1176 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	YLR149C	Q99296	730 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	UBR2	Q07963	1872 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FPR4	YLR449W	STE2	D6VTK4	431 aa		13.02	□□□□□ -0.33
FPR4	YLR449W	YPR089W	O13585	888 aa		13.02	□□□□□ -0.33
FPR4	YLR449W	SNT1	P25357	1226 aa		13.02	□□□□□ -0.33
FPR4	YLR449W	VAC17	P25591	423 aa		13.02	□□□□□ -0.33
FPR4	YLR449W	RAD14	P28519	371 aa		13.02	□□□□□ -0.33
FPR4	YLR449W	BEM1	P29366	551 aa		13.02	□□□□□ -0.33
FPR4	YLR449W	SPR1	P32603	445 aa		13.02	□□□□□ -0.33
FPR4	YLR449W	RRN3	P36070	627 aa		13.02	□□□□□ -0.33

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