RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W VMA8P32610 256 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W NPL6P32832 435 aa4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YPT10P38146 199 aa4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W MAL33P38157 468 aa4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W UTP9P38882 575 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W MAM1P40065 302 aa4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W SPO22P40511 975 aa4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W DJP1P40564 432 aa4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W GPD2P41911 440 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YNL092WP53934 400 aa4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W UBP16Q02863 499 aa4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YML119WQ03208 357 aa4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YDR179W-AQ03983 463 aa4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W TCO89Q08921 799 aa4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data4.99□□□□□ -1.61not detected
YKR047WYKR047W YBR085C-AO43137 85 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W KGD2P19262 463 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W AMD2P22580 549 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W OCA4P25366 362 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W CDC15P27636 974 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W PMI40P29952 429 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W PXA2P34230 853 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W MTH1P35198 433 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YKL050CP35736 922 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W BYE1P36106 594 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W GLG1P36143 616 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W RPF2P36160 344 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YHL017WP38745 532 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W UBX6P47049 396 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YMR206WQ03695 313 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W SKG3Q06315 1026 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YDL242WQ07746 117 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W GRC3Q07845 632 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W SFI1Q12369 946 aa4.98□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W CET1O13297 549 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W COX1P00401 534 aa4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W CBS1P14066 229 aa4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W KAR3P17119 729 aa4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W POL4P25615 582 aa4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W ERC1P38767 581 aa4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W LAS21P40367 830 aa4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W SEC24P40482 926 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W NPA3P47122 385 aa4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W GLO1P50107 326 aa4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YML053CQ04978 212 aa4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W CRN1Q06440 651 aa4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W MDM20Q12387 796 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa4.97□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W CHO2P05374 869 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W WHI2P12611 486 aa4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W RNR3P21672 869 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W ROX1P25042 368 aa4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W LCB1P25045 558 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W ERG3P32353 365 aa4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W GDA1P32621 518 aa4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W REG2P38232 338 aa4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W COQ6P53318 479 aa4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W KIN4Q01919 800 aa4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W YMR155WQ03795 547 aa4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W YDR109CQ04585 715 aa4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W URN1Q06525 465 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W BAG7Q12128 409 aa4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W RTN2Q12443 393 aa4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W ZPS1Q12512 249 aa4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W PGA3Q12746 312 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W PEX5P35056 612 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W HES1P35843 434 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W SRO77P38163 1010 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W BDH2P39713 417 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W RGI2P40188 164 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W AXL1P40851 1208 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W MSE1P48525 536 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W MSY1P48527 492 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W LCL3P53153 274 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W COG2P53271 262 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W YAT1P80235 687 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W MUK1Q02866 612 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W YML037CQ03703 340 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W GFD1Q04839 188 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W YLR352WQ06479 807 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W SWA2Q06677 668 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W PSR1Q07800 427 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W GET3Q12154 354 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W LCB4Q12246 624 aa4.95□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W YSP3P25036 478 aa4.94□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W RPC53P25441 422 aa4.94□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W LAC1P28496 418 aa4.94□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W DBF4P32325 704 aa4.94□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W TRM2P33753 639 aa4.94□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W UBP13P38187 747 aa4.94□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W DCP2P53550 970 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W AAT1Q01802 451 aa4.94□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W PDX1P16451 410 aa4.93□□□□□ -1.62
YKR047WYKR047W MRPL9P31334 269 aa4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 83.5 ms