RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	MRPL4	P36517	319 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	RTS1	P38903	757 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	LAS21	P40367	830 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YPI1	P43587	155 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	NIT2	P47016	307 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YGR153W	P48238	217 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	MSY1	P48527	492 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	TRS31	Q03337	283 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	THI73	Q07904	523 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	DAP1	Q12091	152 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	NUM1	Q00402	2748 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ATS1	P31386	333 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SWH1	P35845	1188 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	BZZ1	P38822	633 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	APJ1	P53940	528 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	CRZ1	P53968	678 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	DNM1	P54861	757 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YLR455W	Q06188	304 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YLL056C	Q12177	298 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	DNF3	Q12674	1656 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ULS1	Q08562	1619 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	CLB2	P24869	491 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ATG27	P46989	271 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	BFA1	P47113	574 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YNL144C	P53907	740 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SMA1	Q02651	245 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	IZH1	Q03419	316 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	IML1	P47170	1584 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	CTT1	P06115	562 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	CBS2	P14905	389 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YML053C	Q04978	212 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YOR389W	Q08912	624 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	TAH18	Q12181	623 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YDL012C	Q12489	107 aa		0.67	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	GSC2	P40989	1895 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YML002W	P0CF17	737 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	BIK1	P11709	440 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	BET2	P20133	325 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	MGR1	P25573	417 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	MSH1	P25846	959 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	RAD24	P32641	659 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	MTC6	P38849	526 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	PKP2	P53170	491 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ALG12	P53730	551 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	IGO1	P53897	168 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ATG21	Q02887	496 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YHM2	Q04013	314 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SWF1	Q04629	336 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	GTB1	Q04924	702 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	TRI1	Q05024	226 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	THI3	Q07471	609 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	MCH4	Q08268	501 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YIR014W	P40570	242 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	IMA5	P40884	581 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ASK10	P48361	1146 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ECI1	Q05871	280 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	POS5	Q06892	414 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	BSC1	Q12140	328 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	CSR2	Q12734	1121 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	NUP100	Q02629	959 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	UME1	Q03010	460 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	SKY1	Q03656	742 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	EKI1	Q03764	534 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	TSA2	Q04120	196 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	RSF1	Q05043	376 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	PDR8	Q06149	701 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	CHD1	P32657	1468 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YML003W	P0CF16	290 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	AEP2	P22136	580 aa		0.65	□□□□□ -2.31

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