RNA–Protein interactions for RNA: YDR365C

ESF1, Transcript of Nucleolar protein involved in pre-rRNA processing, yeast

Gene ESF1, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ESF1	YDR365C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	PET122	P10355	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	PEP3	P27801	918 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SRP101	P32916	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	HCS1	P34243	683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	CCL1	P37366	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	PEX18	P38855	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YDR089W	P38966	869 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	FLC2	P39719	783 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	PXA1	P41909	870 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ULI1	P43604	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ECM18	Q04623	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YRM1	Q12340	786 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	DRS2	P39524	1355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MET5	P47169	1442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	HIS3	P06633	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SPS22	P25380	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	PTR2	P32901	601 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	DAD2	P36162	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YBR242W	P38331	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SIP3	P38717	1229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SPT8	P38915	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	GPB2	P39717	880 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	PHB1	P40961	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	FET4	P40988	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	IMA1	P53051	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YGL242C	P53066	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	DIP5	P53388	608 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MGR3	Q04472	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ROY1	Q04847	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	DIF1	O13577	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	CDC4	P07834	779 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	TUP1	P16649	713 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SPE2	P21182	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	NFS1	P25374	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YCR051W	P25631	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	PHO91	P27514	894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	GIC1	P38785	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YER158C	P40095	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	BST1	P43571	1029 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	NUP85	P46673	744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SNX4	P47057	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ALT2	P52892	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	COG1	P53079	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	NCS6	P53088	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MDM36	Q06820	579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	AAD4	Q07747	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RSB1	Q08417	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ICL2	Q12031	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	PAN1	P32521	1480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	IQG1	Q12280	1495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	PUT4	P15380	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	CPR2	P23285	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RPC34	P32910	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	FLR1	P38124	548 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MMS4	P38257	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	STN1	P38960	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RRT14	P40470	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RSM25	P40496	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ESBP6	P53918	673 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	STP4	Q07351	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	GPB1	Q08886	897 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ACM1	Q08981	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RCN2	Q12044	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	HER1	Q12276	1246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	KRE6	P32486	720 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MRP4	P32902	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	BUD2	P33314	1104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MIA40	P36046	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	UGA2	P38067	497 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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